科研产出
鼠伤寒沙门菌伴侣蛋白Hfq与oppA mRNA 5′ UTR结合位点的预测与验证分析
《中国兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：OppA与鼠伤寒沙门菌氨基酸和肽的摄取有着重要的关系，oppA mRNA是已验证受Hfq伴侣蛋白依赖型小RNA GcvB转录后调控的靶标，GcvB与oppA mRNA的作用机制已经确认，但Hfq与oppA mRNA之间的互作机制尚未明确。为明确Hfq与oppA mRNA潜在的作用位点，分析Hfq与oppA mRNA (ARN)n基序的作用关系。本研究利用5′-RACE验证oppA mRNA转录起始位点和oppA mRNA 5′UTR,使用Mfold软件预测oppA mRNA部分序列的二级结构并根据(ARN)_n基序的特征筛查oppA mRNA 5′UTR的ARN基序，利用λ-Red同源重组技术构建oppA mRNA不同(ARN)n基序敲除和突变的lacZ基因融合菌株，通过qRT-PCR试验和β-半乳糖苷酶试验的检测oppA的转录水平和蛋白表达量的变化。经验证oppA mRNA 5′UTR长度为159 bp,在oppA mRNA 5′UTR中预测到2个Hfq结合偏好型基序ARN-1和ARN-2。对ARN-1和ARN-2基序分别或同时敲除或点突变，oppA mRNA的转录水平和蛋白水平的变化呈现相似的结果。与Western blot相比，oppA基因转录和蛋白水平总体呈下调趋势。综上所述，经预测的ARN-1和ARN-2基序与Hfq转录后负调控oppA mRNA的作用机制无明显的关联，推测其为oppA mRNA翻译所需元件。
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芥菜SBP-box基因家族全基因组鉴定与表达分析
《东北农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：SBP-box作为植物特有转录因子家族,广泛参与植物生长发育调控与响应逆境胁迫.从芥菜全基因组中鉴定SBP-box基因家族,分析家族成员理化性质、序列特征、互作调控网络、进化关系及表达模式.结果表明,芥菜SBP-box共包含58个成员,均含有1个保守SBP结构域,启动子区域含有多种非生物胁迫响应与激素响应的顺式作用元件,BjuSBP-microRNA-靶基因构建复杂的调控网络,参与有机物生物合成、RNA代谢过程调控、花器官发育、营养相变化、细胞代谢调节等生物学过程.在低温胁迫下,BjuSBP1a、BjuSBP1b、BjuSBP1e、BjuSBP4l、BjuSBP4m等基因显著上调表达,在光胁迫下,大多数家族基因表达受抑制,其中BjuSBP1a、BjuSBP9d在两种胁迫下均上调表达,推断其在芥菜非生物胁迫应激反应中发挥功能作用,可作为培育芥菜抗逆新品种候选基因资源.
关键词： 芥菜 SBP-box转录因子 生物信息学 表达分析
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刺梨果汁类产品品质分析与综合评价
《化学试剂 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：建立刺梨果汁类产品品质综合评价体系，为贵州刺梨加工产品推广宣传提供参考。以贵州不同地区生产的14份刺梨果汁产品为试材，测定了包含可溶性固形物、蛋白质、可溶性糖及可滴定酸在内的基础品质指标，以及6种有机酸和超氧化物歧化酶（Superoxide Dismutase, SOD）、类黄酮和总酚3种活性物质含量，对21个品质指标进行相关性、主成分分析及系统聚类。综合21个指标分析共获得4个主成分，累积贡献率达92.77%,包含了所检品质中绝大部分指标信息，建立了刺梨类果汁产品品质综合评价模型为F=0.640×F1+0.142×F2+0.090×F3+0.056×F4;在类间距离为18时，14份供试样品被聚为3类，第1类聚集了7份样品，其抗坏血酸、活性物质SOD、类黄酮和总酚以及元素含量较高，糖含量较低；第2类仅有1份样品，但其活性物质、可滴定酸和可溶性蛋白质含量最高；第3类聚集了其余6份样品，特点是固酸比、糖酸比较高，其余指标排名较为靠后。14份样品综合品质由高到低依次为：YPC＞JHJ＞YGT＞YAJ＞YGW＞YSY＞YSC＞YPT＞JPY＞JGS＞JPL＞JPS＞JSQ＞JSJ。
关键词： 刺梨果汁 品质指标 主成分分析 相关性分析 聚类分析
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黑老虎内生真菌及根际土壤真菌的群落结构与生态功能分析
《广西植物 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探讨黑老虎（Kadsura coccinea）根际土壤和组织内生真菌菌群的组成及其生态功能，该研究采用ITS高通量测序技术对成熟黑老虎（根、茎、叶）内生真菌及根际土壤真菌群落结构、多样性和生态功能进行了分析。结果表明：（1）从12个样品中共获得2 241个可操作分类单元（OTU）,涉及10门、41纲、95目、212科、367属，内生真菌（根、茎、叶）和根际土壤真菌OTU数分别为386、536、258、1 435个，其中共有的OTU为18个。在门水平上，黑老虎内生真菌及根际土壤真菌优势群落均为子囊菌门和担子菌门，其中子囊菌门在叶和茎中占比分别高达96.99%和95.37%;在属水平上，黑老虎根际土壤真菌中腐生真菌被孢霉属占比较高（为13.5%）,叶和茎等生长旺盛的组织中子囊菌门未分类属和痂囊腔菌属占比较高。（2）α多样性分析结果显示，黑老虎根际土壤真菌群落的丰度和多样性明显高于内生真菌，茎中内生真菌丰度显著高于根和叶，而根、茎和叶组织间内生真菌多样性差异不显著；PCoA分析结果显示，叶和茎的真菌群落结构相似性更高。（3）利用FUNGuild数据库进行的功能预测分析结果显示，黑老虎根际土壤真菌和内生真菌含有大量的未分类菌群；功能已分类菌群中，病理寄生型功能群在生长旺盛的组织中占比较高。该研究结果为黑老虎优异功能菌的筛选和发掘提供了理论依据。
关键词： 黑老虎 高通量测序 ITS 内生真菌 根际土壤真菌 多样性 FUNGuild
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红和绿香椿芽贮藏过程中花青素和木质素含量及相关基因表达分析
《西北植物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了探究低温贮藏对香椿芽品质的影响,研究以贵州省织金县板桥镇红光村种植的红和绿香椿芽为材料,在4 ℃低温黑暗贮藏过程中对其叶片和叶柄进行外观形态和组织细胞学观察,花青素、木质素含量及其相关合成基因表达水平分析.结果表明,(1)红香椿芽贮藏3 d后色泽保持较好,而绿香椿芽贮藏1 d后开始出现黑色斑点,且黑色斑点的数量随贮藏时间的延长逐渐增加;(2)红香椿芽叶脉和叶柄木质部细胞比相应绿香椿芽小且数量少;红、绿香椿芽贮藏过程中次生细胞壁均逐渐增厚,且绿香椿芽叶脉和叶柄细胞染色程度较深;(3)在低温贮藏过程中,红、绿香椿芽花青素含量均降低,木质素含量均升高,红香椿芽花青素含量始终高于绿香椿芽,而其木质素含量始终低于绿香椿芽,且红香椿芽升降幅度较小;(4)在采后低温贮藏过程中,香椿芽叶片和叶柄中花青素和木质素相关合成基因的表达水平与花青素和木质素含量的变化趋势基本一致.研究表明,红、绿香椿芽贮藏过程中均发生了木质化和蒸腾失水,花青素含量降低,但绿香椿芽的变化更明显;香椿芽花青素和木质素含量的差异与其合成相关基因的表达水平具有相关性.
关键词： 香椿芽 低温 贮藏 细胞学观察 木质素含量 花青素含量 基因表达
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干旱胁迫下枯草芽孢杆菌对玉米苗期叶片的生理生化调节
《西北农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究干旱胁迫下不同枯草芽孢杆菌对玉米苗期叶片的生理调节作用,通过对干旱与正常水分下玉米根部接种R9-1、R59、R60等3种不同植物根际的枯草芽孢杆菌及R59+R60组合菌种,测定玉米苗期叶片的抗氧化酶活性、细胞渗透物质、细胞膜氧化产物、H2O2、内源激素、相对含水量等生理生化调节物质以及叶片的K、P、N含量.通过主成分分析与相关性分析发现接种枯草芽孢杆菌主要影响玉米苗期叶片的可溶性糖、脱落酸(ABA)、磷(P)含量、超氧化歧化酶(SOD)活性、过氧化氢酶(CAT)活性、过氧化物酶(POD)活性、叶片游离脯氨酸(PRO)含量、叶片相对含水量,其中叶片相对含水量与其他生理表现因子呈显著的负相关关系.干旱胁迫下,接种枯草芽孢杆菌的玉米苗期叶片抗氧化酶活性、细胞渗透调节物质、P、N含量显著降低.接种R9-1、R59降低H2O2与ABA含量,接种R60、R59+R60提高ABA含量,接种R59、R60、R59+R60降低吲哚乙酸含量.隶属函数综合分析枯草芽孢杆菌对玉米的调节作用排名为:正常情况下R60>R59>R9-1>R59+R60>CK1;干旱胁迫下 R60>R59+R60>R59>R9-1>CK2.综上所述,接种枯草芽孢杆菌玉米苗期叶片的生理表现为抗氧化酶活性、细胞渗透调节物质、P、N含量显著降低,同时R59、R60、R59+R60均有效提升玉米苗期叶片的相对含水量,说明接种枯草芽孢杆菌玉米苗期受干旱胁迫影响程度较小,所以接种枯草芽孢杆菌具有提升玉米苗期适应干旱胁迫的调节能力,从而保证自身的生长发育.
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糯高粱与大豆间作模式下不同带宽配置对糯高粱根际土壤特性及产量的影响
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究糯高粱与大豆间作模式不同带宽配置下糯高粱根际土壤特性及产量的变化,为糯高粱的优质高产及可持续生产提供科学依据.[方法]采用完全随机区组设计于2021年和2022年开展田间试验,以单作糯高粱为对照(CK),研究(2行)糯高粱与(1行)大豆间作模式下4种带宽配置(T1,带宽120 cm,糯高粱窄行行距40 cm、宽行行距80 cm,糯高粱与大豆间距40 cm;T2,带宽130 cm,糯高粱窄行行距50 cm、宽行行距80 cm,糯高粱与大豆间距40cm;T3,带宽140 cm,糯高粱窄行行距40 cm、宽行行距100 cm,糯高粱与大豆间距50 cm;T4,带宽150 cm,糯高粱窄行行距50 cm、宽行行距100 cm,糯高粱与大豆间距50 cm)对糯高粱根际土壤养分含量、土壤酶活性及产量的影响.[结果]糯高粱间作大豆不同带宽配置处理对糯高粱根际土壤特性及产量均有显著影响.不同带宽配置处理下糯高粱根际土壤养分含量和酶活性及产量均显著高于单作糯高粱处理,且均以T3表现最好.在2021年和2022年,T3根际土壤有机质、全氮、全磷、全钾、碱解氮、有效磷和速效钾含量分别为69.85和61.12 g/kg、0.84和1.08 g/kg、0.39 和 0.51 g/kg、44.61 和 46.92 g/kg、344.58 和 266.63 mg/kg、25.79 和 26.16 mg/kg、16.32 和 23.60 mg/kg,其 2 年均值较CK分别增加18.47%、13.36%、26.00%、12.18%、60.85%、43.47%和49.24%;脲酶、多酚氧化酶、蔗糖酶、硝酸还原酶和过氧化氢酶活性分别为 207.94 和 180.27 U/g、53.43 和 70.90 U/g、150.09 和 208.64 U/g、0.43 和 0.40 U/g、48.06 和 51.38 U/g,其2年均值较CK分别增加49.37%、45.61%、76.10%、55.81%和18.89%;产量分别为6199.18和6467.28 kg/hm2,其2年均值较CK增加22.68%.[结论]本试验条件下,糯高粱间作大豆的适宜带宽配置为带宽140 cm,糯高粱窄行行距40 cm、宽行行距100 cm,糯高粱与大豆间距50 cm.
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不同LED补光时长对多肉'艳日辉'形态及生理的影响
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究以多肉植物‘艳日辉’（Aeonium decorum f. variegata）为材料，研究不同LED补光时长（2, 4和6 h）对多肉植物生长性状和生理指标的影响，并筛选出最佳的补光时长。结果表明：与自然光相比，补充LED光源能增加‘艳日辉’植株的株高、冠幅，使植株叶片饱满、叶色更鲜艳。随着补光时长增加，Chl含量、OPC含量、SS含量、根系活力等指标总体呈上升趋势；相对电导率、Pro含量、MDA含量呈现下降趋势。植株氮、钾元素富积较多，磷元素变化不显著。本研究基于各项指标隶属函数综合评价得出，补光4 h最有利于‘艳日辉’生长及观赏品质的改善。本研究结果为多肉植物的光调控提供一定的理论依据，并对积极探寻多肉植物的高效设施栽培有着重要意义。
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长江水生生物资源与环境本底状况调查(2017-2021)
《水产学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：长江是中华民族的母亲河，为了落实长江大保护，农业农村部统筹部署设立长江渔业资源与环境调查（2017—2021）。由中国水产科学研究院总牵头，中国水产科学研究院长江水产研究所技术总协调，联合流域内外24家科研院所和高校，对长江流域重点水域的鱼类种类组成及分布、鱼类资源量、濒危鱼类、长江江豚、渔业生态环境、消落区、捕捞渔业和休闲渔业等7个专题开展了系统调查。调查结果显示，（1）长江历史（2017年前）分布鱼类记录有18目37科163属443种，本次调查中有135种鱼类未采集到，新采集到15种外来鱼类；（2）当前鱼类资源数量约为8.86亿尾，重量约为12.48万t，仅相当于20世纪50年代的27.3%、80年代的58.7%，流域性优势种为鲤、鲫、鲢、黄颡鱼、短颌鲚、鲇、蛇、草鱼、光泽黄颡鱼、?、鳜、铜鱼、翘嘴鲌、鳊、鳙，重量占比达50%，数量占比达45%；（3）长江流域的国家一、二级重点保护鱼类29种（属），本次调查共记录到15种，白鲟已被IUCN认定灭绝，鯮和鲥已多年未见野生个体，长江鲟被IUCN认定野外灭绝，中华鲟、胭脂鱼和松江鲈多年未见自然繁殖；（4）2017—2021年，长江中下游干流、洞庭湖和鄱阳湖的长江江豚个体数量整体稳中有升，分布范围有所扩大；（5）长江流域水质总体较好，整体符合渔业水质标准；（6）长江流域重点水域2019—2020年最大水面19 663 km~2，最小水面14 281km~2，消落区总面积6 337 km~2，其中反季节性消落区633 km~2；（7）禁捕前，长江捕捞渔业从业者以初中学历以下的中老年为主。调查结果表明，长江全面禁捕退捕是长江水生生态系统保护的生态工程，更是渔民产业转型生存条件改善的民生工程，禁捕后鱼类资源将有显著恢复，长江江豚种群规模也有望稳中有升，但濒危鱼类的处境依然堪忧，衰退的消落区将成为制约未来长江水生生态系统恢复的限制性因素。作为长江流域重要水域全面禁捕前展开的系统调查，本调查结果可以为长江禁捕效果评估提供基准。
关键词： 鱼类 长江江豚 资源量 水生生态系统 渔业 本底调查 长江水系
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植物乳杆菌和短乳杆菌复合添加对高丹草青贮效果的影响
《草地学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为研究不同乳酸菌互作对高丹草(Sorghum bicolor×Sorghum sudanense)青贮效果的影响,将前期筛选的植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)和短乳杆菌(L.brevis)按不同比例(1 ∶ 0(LP06),0 ∶ 1(LBR02),4 ∶ 1(F-1),3 ∶ 2(F-2),2 ∶ 3(F-3),1 ∶ 4(F-4),1 ∶ 1(F-5))添加至高丹草,并以添加蒸馏水为对照,青贮60 d和开窖6 d时测定发酵品质、营养成分、主要微生物数量,开窖后记录青贮中心温度变化.结果表明:青贮60 d后,F-1处理NH3-N含量最低、乳酸含量最高,与对照差异显著(P<0.05);LBR02处理乙酸含量最高,与对照差异显著(P<0.05);F-2处理粗蛋白含量最高,显著高于对照(P<0.05);F-3处理酵母菌数量最低,显著低于对照(P<0.05);开窖第6天,增加短乳杆菌添加比例对减少青贮粗蛋白损耗、抑制酵母菌、霉菌生长作用显著.根据隶属函数法综合评价,植物乳杆菌LP06和短乳杆菌LBR02以2 ∶ 3比例混合添加,高丹草青贮效果表现最优.
关键词： 高丹草;植物乳杆菌;短乳杆菌;青贮品质;有氧稳定性
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