科研产出
澳洲坚果新品种'正成1号'
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：‘正成1号’是从云南云县澳洲坚果基地的实生群体中选育而成的新品种。青皮果饱满、壳果圆形、种脐不明显；青皮果平均单果质量24.12 g，鲜壳果单果质量12.01 g，出籽率50.1%，出仁率37%，果仁含油量73.9%，蛋白质含量9.87%。盛果期青皮果单株产量为36.8 kg。该品种产量高，耐瘠薄，抗旱，适宜海拔800～1 000 m、年均温大于17.5℃、年降雨量大于1 000 mm及相似地区种植。
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小立碗藓泛素连接酶U-box家族的鉴定及表达分析
《广西植物 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：U-box家族编码E3 泛素连接酶能够特异性识别底物,从而调控蛋白的修饰和降解过程.为鉴定小立碗藓U-box家族成员,分析其生物学特征及基因表达规律,该研究基于小立碗藓的全基因组测序数据,通过生物信息学技术对泛素连接酶U-box家族成员的理化性质、进化关系、顺式作用元件、组织表达模式、胁迫响应等进行了分析.结果表明:(1)在小立碗藓全基因组中共鉴定得到 31 个U-box家族成员,并且不均匀地分布于 14 条染色体上;其分子量大小在 37.75~117.49 kDa之间,等电点介于 5.32~8.55 之间.(2)进化树显示,小立碗藓的U-box家族成员分布在Ⅰ-Ⅸ亚家族中,其中亚家族Ⅶ含有小立碗藓成员最多,共 11个(约占 36.67%),说明小立碗藓在历史进化过程中具有高度保守性且功能多样化.(3)经启动子分析发现,小立碗藓U-box家族成员具有结合GA和ABA等多个激素的元件.(4)组织表达分析发现小立碗藓U-box家族成员主要在绿丝体、轴丝体和孢子体S3 时期大量表达.(5)通过ABA、甘露醇和饱和LiCl处理后发现,配子体的拟茎均发生黄化且PpPUB21 的表达量均被显著诱导.推测小立碗藓U-box家族成员在生长发育和响应逆境胁迫中发挥着重要作用,这为后续深入研究小立碗藓U-box家族成员的基因功能研究奠定了理论基础,也为其相关研究提供了参考.
关键词： 小立碗藓 U-box家族 基因表达 功能分析 全基因组鉴定
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红肉火龙果果糖激酶基因HpFRK1克隆、表达与酶学活性分析
《西北植物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】克隆红肉火龙果果糖激酶基因，检测其表达和酶活性，解析其对果实发育可溶性糖积累的生理功能。【方法】从‘紫红龙’果肉克隆HpFRK1基因，进行生物信息学和亚细胞定位分析，利用qRT-PCR检测基因表达，通过大肠杆菌诱导表达获得重组蛋白并检测酶活性。【结果】HpFRK1的开放阅读框长度为993 bp,编码330个氨基酸，具有磷酸果糖激酶B家族结构域。HpFRK1与甜菜BvFRK亲缘关系最近，均属于细胞质定位的FRKs。HpFRK1在成熟茎和不同发育时期果实均表达，在花后20 d的果实表达量最高，随果实发育逐渐下调，花后30 d（果实成熟）表达量最低。亚细胞定位检测表明HpFRK1主要定位于细胞核和细胞质。诱导获得的HpFRK1重组蛋白特异性催化果糖磷酸化（Km为11.01 mmol/L）。【结论】HpFRK1在细胞质特异性催化果糖磷酸化，在红肉火龙果果实发育期间负调控果实可溶性糖积累。
关键词： 红肉火龙果 果糖激酶 基因克隆 表达分析 原核表达
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黄瓜新品种'黔园绿3号'
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：‘黔园绿3号’黄瓜是以纯合DH系SG049为母本,以纯合DH系SG002为父本配置而成的高产高抗的一代杂交种,从播种到始收58 d,生长势强,果实长棒形,瓜把短,口感微甜,平均单瓜质量0.32 kg,干物质量33.2 g·kg-1,高抗白粉病、抗霜霉病,耐高湿、耐低温寡日照,平均产量10 200 kg·hm-2左右,适宜贵州省露地栽培。
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基于辐射诱变技术的骨干玉米自交系ZH6218改良及表型性状变异分析
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】对骨干玉米自交系ZH6218辐射后代进行改良及表型性状变异分析，以期解析辐射后代的表型多样性，为利用辐射诱变技术改良骨干玉米自交系及创制优势新基因资源提供理论依据。【方法】以西南区广泛应用的玉米骨干自交系ZH6218为材料，利用200 Gy剂量的60Co-γ射线对其种子进行处理，对获得的1300个辐射后代进行产量、株型和生育期相关性状变异分析，并通过计算Shannon-Weaver遗传多样性指数（H'）分析辐射后代的遗传多样性。【结果】辐射后代的11个表型性状表现出丰富的多样性，变异系数为6.93%～45.79%，平均为19.69%，其中苞叶长的变异系数最大，粒长的变异系数最小，且除粒长和粒宽外，其余性状的变异系数均大于10.00%;11个表型性状的H'为1.19～2.10，平均为1.97，其中穗位和行粒数的H'最高，穗行数的H'最低。相关分析结果显示，11个表型性状中，大部分性状间存在极显著相关性（P<0.01，下同），其中百粒重与株高、叶夹角、穗长、穗粗、粒长、粒宽呈极显著正相关。辐射后代被划分为四大类群，其中第Ⅰ类群包含3份材料，可作为高产种质进一步筛选；第Ⅱ类群包含2份材料，穗位高、百粒重低，综合性状较差；第Ⅲ类群包含511份材料，百粒重较重，综合表现中等，具有一定高产的潜力；第Ⅳ类群包含365份材料，株高和穗位最矮，可作为矮秆材料基因资源进行后续改良利用。基于主成分分析及综合评价结果，筛选出10份优异辐射后代。【结论】利用辐射诱变技术可快速实现骨干自交系的改良及创制新的基因资源，辐射后代除粒长和粒宽外，其余性状变异丰富，多样性高。筛选出的10份表型性状优异的辐射后代，可作为ZH6218的衍生新材料用于玉米育种研究。
关键词： 玉米 骨干自交系 辐射诱变 表型性状 变异 多样性
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青贮玉米品质相关性状的全基因组关联分析
《华中农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了初步揭示玉米粗蛋白含量、淀粉含量、中性洗涤纤维（neutral detergent fiber, NDF）含量、酸性洗涤纤维（acid detergent fiber,ADF）含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率等性状的遗传规律，按照随机区组设计将183份自交系为材料种植于贵阳，测定玉米粗蛋白含量、淀粉含量、NDF含量、ADF含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率，利用Maize SNP 50芯片对供试材料进行基因分型，采用混合线性模型进行全基因组关联分析，结果显示，分别鉴定出31、61、11、36、20和42个与粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖及体外干物质消化率显著相关的单核苷酸多态性位点（SNP）(P<0.001)，对表型变异的解释率分别为5.80%～11.40%、5.78%～11.38%、5.78%～7.85%、5.81%～10.37%、5.78%～7.35%和5.79%～11.33%。同时，发现SYN6712、PHM1190.3、SYN7541和PZE-104072386属于一因多效位点；其中，6号染色体上的SYN6712、PHM1190.3和SYN7541同时与淀粉、体外干物质消化率显著关联，4号染色体上的PZE-104072386同时与ADF、可溶性糖显著关联，经过等位变异鉴定发现T/T基因型是SYN6712和PHM1190.3的优异等位变异，并挖掘到了Zm00001d037272、Zm00001d037386、Zm00001d037532和Zm00001d051166等候选基因。
关键词： 青贮玉米 品质性状 全基因组关联分析 单核苷酸多态性位点 优异等位变异 候选基因
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基于120K液相芯片对310份小麦种质的遗传多样性分析
《麦类作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了解贵州小麦农家种与其他地方育成品种间基因组中被选择的区域，对来自中国黄淮麦区和西南麦区的310份小麦材料进行了120K液相芯片检测。结果表明，该群体可以分为中国北方、中国南方和贵州农家种3个相对独立的类群，其中四川的小麦遗传多样性相对较高，贵州农家种遗传多样性较低。其原因可能是四川小麦含有一定的阿勃血统和人工合成小麦的血缘，对小麦的增产增收具有突出作用，而贵州农家种在现代育种中使用频率很低。陕西的小麦品种在第一、第三和第五亚群中，可能是陕西当地的材料引进了其他地方的小麦种质资源，通过杂交或者回交产生了新的品种（系）,血缘上更加丰富，遗传多样性更高。通过对贵州农家种/其他地方育成品种（系）之间选择性消除分析，利用π、Fst、XP-CLR等方法鉴定到与春化、株高、芒长、抗病、抗逆等相关的37个基因，包括了诸如TaVRN2-5A、TaDIR-A1、Rht12和ALI-1/B1/Tipped1/AWNS1等的重要位点。由此可见，中国部分育成小麦品种存在遗传多样性差异，建议通过开发新的育种策略，聚合优异等位基因，促进对地方农家种合理利用。
关键词： 普通小麦 遗传多样性 液相芯片 群体结构 选择清除
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BdCDF1基因表达模式分析和亚细胞定位分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：光周期是植物开花调控中的主要途径之一，CDF1则是光周期调节植物开花的关键基因。为了研究二穗短柄草BdCDF1基因在不同光照下的表达模式和CDF1的亚细胞定位，本研究采用二穗短柄草为材料，利用荧光定量PCR技术研究BdCDF1在植物不同发育时期和不同光照条件下的表达情况；通过GFP融合蛋白表达法观察BdCDF1蛋白的亚细胞定位。荧光定量PCR结果表明，BdCDF1在不同光照长度下和不同的生长发育时期下表达情况不同，在长日照处理和短日照处理下，BdCDF1的表达高峰都出现在ZT24这个时间点上，表现出了一定的昼夜节律；在转入连续光照后，BdCDF1的表达高峰又都转移至ZT20这个时间点，且黑暗处理下BdCDF1的表达水平整体上要小于光照处理下的表达水平，这体现了BdCDF1的表达在一定程度上受到光周期的影响；亚细胞定位结果显示BdCDF1蛋白位于细胞核中。本研究结果表明BdCDF1基因表达受到昼夜节律和光周期的共同调控，暗示BdCDF1在二穗短柄草的光周期途径调控开花的过程中发挥重要作用，为后续BdCDF1基因的功能验证打下基础。
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非洲菊应答尖孢镰刀菌侵染的转录组分析
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探明尖孢镰刀菌胁迫下非洲菊根系基因表达的变化，挖掘非洲菊根系抗病菌胁迫的相关基因及信号通路等分子机制，为非洲菊根腐病防治提供理论参考。【方法】以健康非洲菊根系和被尖孢镰刀菌侵染96 h感病的非洲菊根系为材料，采用转录组测序技术对其进行转录组测序，筛选差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释和KEGG代谢通路富集分析，再通过实时荧光定量PCR验证转录组测序结果的可靠性。【结果】从尖孢镰刀菌侵染非洲菊根系获得10 218个DEGs,其中上调基因7273个，下调基因2945个。有3401个DEGs隶属于72个转录因子家族，其中，数量最多的转录因子为MYB和AP2/EFR家族，其次为C2H2、bHLH、NAC和C3H等家族。GO富集结果显示，DEGs共注释到53个功能组，其中氧化还原过程、胞质溶胶、细胞分裂位点、膜组成成分、金属离子结合等的DEGs较多。KEGG代谢通路富集结果表明，DEGs显著富集在碳水化合物代谢、能量代谢、脂质代谢、氨基酸代谢等生物合成途径。3条碳水化合物代谢途径多数DEGs上调。光合作用途径和光合作用-天线蛋白途径中多数DEGs表现下调。在α-亚麻酸代谢途径中，共有49个差异表达基因被富集，其中4个脂氧合酶(LOX2S)基因和2个氢过氧化物脱水酶(AOS)基因均下调表达。【结论】MYB、AP2/EFR、C2H2、bHLH、NAC和C3H等转录因子家族成员以及调控光合作用、碳水化合物代谢、脂质代谢等相关差异表达基因，可能在参与响应非洲菊抗根腐病胁迫应答中发挥重要作用。
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辣椒新品种'香辣四号'
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：‘香辣四号’是以108A作母本、017作父本育成的杂交一代鲜食型线椒新品种。果实线形、单生向下,大小均匀,长17.5 cm,宽1.4cm,单果19.48 g,果面油亮光滑,果柄长4.7 cm,青果绿色、熟果红色,青果干物质含量达到11.98%,蛋白质7.58%,粗脂肪15.21%,盐酸不溶性灰分0.084%,粗纤维20.79%,维生素C含量127.56 mg·kg-1。全生育期约184 d。鲜椒产量38 449.1 kg·hm-2。适宜在贵州省遵义市、黔东南州、毕节市、铜仁市、安顺市、贵阳市等地春季种植。
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