科研产出
蒙古马和纯血马免疫相关基因差异表达分析
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了评价蒙古马（Equus mongolian horse）和纯血马（E.thoroughbred）免疫生理机能在适应特殊生存环境和人工选择压力过程中相关基因的表达多样性。本研究对健康成年蒙古马（n=3）和纯血马（n=3）的颈静脉血液进行RNA-Seq和品种间表达谱比较分析。对2岁左右健康蒙古马（n=3）和纯血马（n=3）采集肝脏、脾脏、肺脏和血液样品，利用qRT-PCR方法，分析NF-κB信号通路7个基因在两个品种中的表达情况。利用Western blot方法，分析蒙古马和纯血马肺脏中核因子κB亚基p65 （RELA proto-oncogene NF-kB subunit, NF-κB p65）蛋白和白细胞介素1β （interleukin 1 beta, IL-1β）蛋白的表达情况。结果表明，RNA-Seq共获得19.69～23.95 Gb的高质量数据和1 199个差异表达基因，许多差异表达基因直接参与机体的免疫过程。NF-κB信号通路7个基因在蒙古马和纯血马4个免疫组织中均表达，基因表达的品种间差异存在组织多样性；7个基因在蒙古马肺脏的表达量均高于纯血马，除肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor,TNF-α）基因差异不显著外（P≥0.05）,其余基因均具有生物学统计意义（P＜0.05）。NF-κB p65蛋白和IL-1β蛋白在蒙古马肺脏的表达量高于纯血马（P＜0.05）。许多免疫相关基因在蒙古马和纯血马免疫组织之间差异表达，可能和蒙古马适应特定环境以及纯血马的运动性能定向选育有关。本研究结果为进一步研究蒙古马免疫功能适应特定环境的分子机制提供数据支持。
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苏尼特羔羊褐色脂肪鉴定及特征研究
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：哺乳动物脂肪组织主要可以分为白色脂肪组织和褐色脂肪组织，无论细胞形态还是功能，褐色脂肪与白色脂肪都有较大差别。褐色脂肪在哺乳动物产热以及能量平衡方面发挥着重要作用。为探究绵羊褐色脂肪分布特点，本研究采集了出生1、7和30 d苏尼特羊的肾周、颈部、背部、尾部、胸部、腹股沟和心包脂肪，通过HE染色、透射电镜和免疫组织化学鉴定脂肪组织类型，并通过实时荧光定量PCR和Western blot探究苏尼特羔羊不同日龄以及不同部位褐色脂肪的特点。结果发现，苏尼特羔羊体内存在两种不同类型的脂肪细胞，多室小脂滴的褐色脂肪细胞和空泡状脂滴的白色脂肪细胞。褐色脂肪细胞内有嵴的线粒体较多，并检测到褐色脂肪组织特异性蛋白UCP1的表达。而白色脂肪细胞内很少有带规则嵴的线粒体，不表达UCP1。出生1和7 d时褐色脂肪细胞数量及UCP1表达无显著差异，但出生30 d时明显下降。本研究通过形态学观察和标记基因以及蛋白检测鉴定了苏尼特羔羊的褐色脂肪和白色脂肪，证明了肾周脂肪和尾部脂肪分别是褐色脂肪以及白色脂肪的主要来源部位。出生1和7 d时苏尼特羔羊体内褐色脂肪较多，出生30 d时褐色脂肪的表型变化较大，呈现下降的趋势。本文探究了苏尼特羔羊褐色脂肪的特点，为反刍动物褐色脂肪研究提供了一定的基础。
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9个多花黑麦草品种在土默川地区的生产性能和营养价值分析
《中国草地学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：在内蒙古土默川地区种植9个多花黑麦草品种,对其生产性能及营养品质进行测定,并采用灰色关联度法进行综合分析,结果表明:各参试品种在内蒙古土默川地区可刈割4茬,第2茬和第4茬生长速度较快,日均生长速度最快分别可达2.76 cm/d和2.92 cm/d;4茬鲜草产量在60156.67~113463.33 kg/hm2之间,品种马克西姆的鲜草产量最高;品种邦德的粗蛋白质含量最高,为21.78%DM;品种剑宝的中性洗涤纤维含量最低,为53.20%DM.灰色关联度法综合分析结果显示,品种邦德、特高、马克西姆和海克里斯的综合性状表现较好,适宜在土默川地区推广种植.
关键词： 多花黑麦草 生产性能 营养品质 灰色关联度 聚类分析
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添加玉米粉对盐碱地和非盐碱地紫花苜蓿青贮品质和微生物多样性的影响
《中国草地学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：试验设置盐碱地紫花苜蓿单贮(SM0),盐碱地紫花苜蓿+10%玉米粉(SM10),非盐碱地紫花苜蓿单贮(NSM0),非盐碱地紫花苜蓿+10%玉米粉(NSM10),检测并分析各组发酵60d后青贮饲料营养成分、青贮品质和微生物多样性.结果显示,盐碱地较非盐碱地紫花苜蓿青贮饲料可溶性碳水化合物、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维含量高,粗蛋白、粗灰分含量低;非盐碱地较盐碱地紫花苜蓿青贮饲料乳酸、乙酸含量高,丁酸含量以及氨态氮/总氮低(P<0.05),V-score评分增加,发酵品质提高.添加玉米粉后,盐碱地和非盐碱地紫花苜蓿青贮料中干物质、可溶碳水化合物与乳酸含量显著升高,丁酸含量及氨态氮/总氮显著降低(P<0.05).盐碱地紫花苜蓿鲜草中乳杆菌属、魏斯氏菌属、肠球菌属相对丰度高于非盐碱地;添加玉米粉增加了二者青贮中乳杆菌属和肠球菌属相对丰度,降低了魏斯氏菌属和梭菌属相对丰度.综上,非盐碱地苜蓿青贮品质优于盐碱地,添加玉米粉改变了微生物群落结构,进而有效地改善了盐碱地和非盐碱地紫花苜蓿青贮发酵品质.
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氮肥基追比例对苏打盐碱土甜菜光合效率及糖产量的调控
《植物营养与肥料学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究氮肥基追比例对苏打盐碱土甜菜光合特征、产量和质量的调控效应,为甜菜高效施肥提供依据.[方法]田间试验于 2020-2021 年在内蒙古通辽市开展,在氮(N)总量 150 kg/hm2 基础上,设置 9 个氮肥基追比例处理:10:0:0(N10)、8:2:0(N821)、7:3:0(N731)、6:4:0(N641)、5:5:0(N551)、8:1.6:0.4(N822)、7:2.1:0.9(N732)、6:2.8:1.2(N642)、5:3.5:1.5(N552),和不施氮肥对照(CK),共 10 个处理,追肥时期在叶丛快速生长期(V1)和块根生长及糖分积累期(V2)进行.在V1、V2 和糖分积累期(V3),测定光合指标和生物量,收获期调查甜菜含糖率、产量和产糖量.[结果]与CK处理相比,施氮显著提高了甜菜叶片光合能力、干物质积累量以及产量;基肥比例大于 70%的处理含糖率无显著降低;基肥比小于 60%的处理对产量无显著影响;除N551 和N552 处理外,其余处理产糖量均显著提高,N732 处理的产糖量两年均显著高于其他处理(P<0.05).与N10 处理相比,氮肥分期施用提高了V1 期甜菜叶片光合能力、干物质积累量,且同一基肥比例下以追肥 1 次优于追肥 2 次;进入V2 期,除基追比N821 和N551 处理外,其余处理甜菜叶片光合能力、干物质积累量均高于对照,且同一基肥比例下以追肥 2 次优于追肥 1 次,其中以N732 处理表现最优,各指标显著高于其余处理,其甜菜叶片净光合速率、胞间CO2 浓度、蒸腾速率、气孔导度、SPAD值两年平均值分别提高17.20%、13.33%、21.34%、21.01%、10.35%,叶片、叶柄、块根及全株干物质积累量分别提高 26.02%、46.69%、47.96%、41.92%.与此同时,N732 处理有效调节了甜菜干物质分配和转运,显著降低了V1 期后地上部干物质比例,提高了块根干物质比例,提高了根冠比,形成了良好"源-库"关系,为产量形成奠定基础.通过主成分分析,甜菜产量和质量与叶片净光合速率、胞间CO2 浓度、蒸腾速率、气孔导度、SPAD值均存在正相关关系.[结论]合理的氮肥基追比可通过对苏打盐碱化耕地甜菜叶片光合特征的调控,实现甜菜产量和质量的提高.本研究中N732 处理的氮肥运筹方式(基肥 105 kg/hm2、叶丛快速生长期追肥 31.5 kg/hm2、块根生长及糖分积累期追肥 13.5 kg/hm2)具有较好的效果,分别提高甜菜产量 19.53%、产糖量 20.47%、氮肥农学效率167.48%、氮肥偏生产力19.53%,可作为苏打盐碱化耕地甜菜高产优质的氮肥管理方式.
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喷施纳米硒对紫花苜蓿产量、营养品质和硒含量的影响
《中国草地学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以紫花苜蓿品种'WL232HQ'为研究对象,分别在出苗期(V1)、分枝期(V2)、现蕾期(V3)、出苗期+分枝期+现蕾期(V4)进行叶面喷施纳米硒,喷施浓度为CK=0 mg/L、T1=30 mg/L、T2=50 mg/L、T3=100 mg/L、T4= 150 mg/L、T5=250 mg/L,对不同处理紫花苜蓿的干草产量、营养品质及硒含量进行分析;基于主成分分析结合模糊数学中隶属函数法筛选最适纳米硒喷施浓度与喷施时期处理,以期为富硒苜蓿实际生产提供理论依据.结果表明:与CK相比,在V1、V2、V4处理下随着浓度的增加,干草产量呈先上升后下降的趋势,在T2处理下达到最大值,显著高于CK(P<0.05);喷施浓度与喷施时期的互作效应对紫花苜蓿的营养品质具有显著影响(P<0.05),V4处理下营养品质处于较高水平,并且随着浓度的增大,粗蛋白质含量和相对饲用价值呈先上升后下降的趋势;随着喷施浓度的增大硒含量呈上升趋势,在T5浓度下达到了最大值,显著的高于CK(P<0.05);基于综合评价表明在紫花苜蓿的出苗期、分枝期、现蕾期3个时期连续喷施浓度为T2的纳米硒效果最好,干草产量达4173.44 kg/hm2,粗蛋白质含量为22.56%DM,相对饲用价值为169.96,硒含量为1.94 mg/kg,提高了16.64倍.
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腐殖酸对盐胁迫下温室黄瓜根际土壤养分及微生物群落结构的影响
《北方园艺 》 2022 北大核心
摘要：以"津优35号"黄瓜为试材,采用盆栽试验法,用150 mmol·L-1 NaCl模拟盐胁迫,通过添加体积比为300、600倍和900倍的腐殖酸进行处理,研究了腐殖酸对盐胁迫土壤养分和微生物群落结构的影响,以期探索腐殖酸对盐胁迫下温室黄瓜土壤微生态环境的作用效果.结果表明:腐殖酸显著提高了 土壤中有机质、速效钾、速效磷和全氮含量,而降低了 pH.在细菌群落结构方面,各处理间细菌α多样性差异不显著,T1和T2中放线菌门、绿弯菌门和浮霉菌门的相对丰度均高于CK,而拟杆菌门和酸杆菌门的相对丰度则相反,细菌在属水平上组成变化并不明显.在真菌群落结构方面,T1和T2中OTU数量和Shan-non指数与CK差异均不显著,而Chaol指数均显著高于CK,腐殖酸还提高了子囊菌门的相对丰度,T1、T2和T3中子囊菌门相对丰度分别较CK高28.07%、26.48%和6.41%,降低了担子菌门和壶菌门的相对丰度,在已知菌属的变化中,毛壳菌属和枝顶孢属的相对丰度升高,根生壶菌属的相对丰度降低.RDA冗余分析表明速效钾是影响细菌群落结构的关键环境因子,而有机质、速效磷和pH则对真菌群落结构起到关键作用.综上,腐殖酸通过改变土壤理化性质及土壤微生物生态系统,对改良土壤盐胁迫具有积极作用.
关键词： 腐殖酸;黄瓜;盐胁迫;微生物
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基于高通量测序的瞿麦叶片转录组分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为获得瞿麦(Dianthus superbus L.)的基因数据并了解其基因功能,本研究通过高通量测序技术对瞿麦幼苗叶片的转录组进行测序,并对其进行生物信息学分析.通过Illumina测序平台共获得10 825条Unigene,总长度为15 384 267 bp.将获得的Unigene分别与Nr、GO、KOG等7大数据库进行比对,最终有8 255条(76.26%)Unigene获得注释.其中8 201条Unigene在Nr数据库中获得注释,注释同源物种主要是甜菜、藜麦;与GO数据库比对后获得注释Unigene 5 886条,分为细胞组分、生物进程和分子功能3个功能大类23个亚类;KEGG数据库共获得注释Unigene 6 204条,共涉及6大类45个亚类346个代谢通路,其中以新陈代谢相关通路分布较多;KOG数据库共获得注释Unigene 5 303条,分为25个功能类别,基因注释最多的为一般功能和翻译后修饰;在所有Unigene中共检测到SSR位点5 201个,以单核苷酸和三核苷酸重复为主.本研究为开展瞿麦功能基因挖掘、次生代谢途径解析和遗传多样性分析提供了理论基础.
关键词： 瞿麦(Dianthus superbus);转录组;基因注释;代谢通路;简单重复序列
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扁茎黄芪转录组测序及生物信息学分析
《华北农学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为获得扁茎黄芪转录组信息及功能基因表达特征,以扁茎黄芪的幼苗叶片为材料,利用Illumina HiSeq平台进行转录组测序及生物信息学系统分析.结果显示,共获得扁茎黄芪Unigene 19280条,总长23472470 bp,其中GC含量达42.74%,测序质量和组装效果较好.通过Blast分析后,分别有12541,10120,9412,8953,7494,5052条Unigene在Nr、Swiss-Prot、GO、KEGG、KOG、COG数据库获得注释.注释到的扁茎黄芪Unigene同源物种以豆科植物为主,尤其是与其同属蝶形花亚科的鹰嘴豆、蒺藜苜蓿和相思子匹配度较高,分别占31.49%,14.50%,11.65%;扁茎黄芪注释Unigene涉及3个GO类别,354条KEGG代谢通路和25个KOG功能分类,其中富集最多的类别分别为代谢过程、一般功能预测和嘌呤代谢,说明扁茎黄芪幼苗期的叶片细胞具有活跃的新陈代谢活动,基因表达丰富.另外,扁茎黄芪Unigene在KEGG数据库中的感染性疾病类别获得较多注释,表明其植株部位也可能具有药用价值.利用MISA软件挖掘到5849个SSR位点,SSR出现频率30.34%.扁茎黄芪基因组内SSR位点丰富、类型多样化,单碱基至六碱基重复全部出现,其中单碱基丰度最高,占40.56%,以A/T、AG/CT和AAG/CTT为优势基元.
关键词： 扁茎黄芪;转录组;生物信息学;Unigene;分子标记
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油莎豆转录组测序及生物信息学分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为获得油莎豆的基因数据和初步了解其基因功能,本研究基于RNA-Seq技术对油莎豆幼苗叶片和根的混合样品进行转录组测序和生物信息学相关分析.对测序数据进行序列组装共获得19 607条Unigene,总长度为21 274 744 bp.将获得 Unigene 分别与 COG、GO、KEGG、KOG、Pfam、Swissprot 和 Nr 数据库进行比对,共计12 896条Unigene被注释,占总数的65.77%.其中7 527条Unigene在GO数据库中比对获得注释,根据功能分为细胞组分、分子功能和生物进程3大类52个亚类;12 288条Unigene在Nr数据库中获得注释,注释的同源序列主要来自菠萝;通过KOG数据库比对,7 271条Unigene被注释到25个类别中,其中参与一般功能、翻译后修饰及信号传导的注释基因最多.在所有Unigene中共检索到154 456个SNP位点,以碱基转换类型为主.本研究为油莎豆功能基因挖掘和分子标记开发提供理论基础.
关键词： 油莎豆(Cyperus esculentus);RNA-Seq;转录组;SNP
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