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茉莉花JsGGPPS基因的克隆及生物信息学与表达分析

福建农业学报 2016

摘要:牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(Geranylgerany pyrophosphate synthase,GGPPS)是萜烯类香气物质合成途径中的关键酶。采用RT-PCR和RACE相结合的方法,克隆了茉莉花牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶基因的全长cDNA(命名为JsGGPPS,GenBank登录号AIY24421.1),采用实时荧光定量PCR技术分析JsGGPPS基因在茉莉花开放过程中的表达模式。结果表明,JsGGPPS全长cDNA为1 410bp,含1 083bp完整的开放阅读框(ORF),其推导的氨基酸序列包含360个氨基酸,属于trans-isoprenyl diphosphate synthases(IPPS)和class I terpene cyclases家族,含链长控制区(CLDR)、2个天冬氨酸富集区以及其他保守区。JsGGPPS基因与独行菜Lepidium apetalum、橡胶草Taraxacum kok-saghyz的同源性分别为91%、86%。实时荧光定量PCR结果表明,茉莉花开放过程中JsGGPPS基因在晚上18:00时表达量较低,呈上调趋势,在22:00时达到最高,呈下调趋势,在翌日2:00时表达量最低,与茉莉花释香趋势相似,为深入研究茉莉花萜烯类香气物质代谢途径奠定基础。

关键词: 茉莉花 萜烯类 香气 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶 克隆 表达分析

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猪伪狂犬病毒 gB 基因序列分析

福建农业学报 2016 北大核心

摘要:2011年以来我国多省免疫猪伪狂犬病毒 gE 基因缺失苗猪场出现变异型猪伪狂犬病毒(PRV)感染,经典猪伪狂犬病毒疫苗(Bartha-k61)对该病无法提供100%有效保护,已有研究发现变异型 PRV 和经典 PRV gE 基因存在特征性变异。为明确变异型 PRV gB 基因特征,本研究对 GenBank 中登录的部分 PRV 代表株 gB基因进行分析比较。结果表明,我国经典型和变异型 PRV 在 gB 蛋白氨基酸编码区第395位、453位、562位和739位存在特征性差异,但不同来源 PRV gB 基因的核苷酸和氨基酸同源性分别在98.1%~100%和96.1%~100%。从相互之间的遗传进化关系可以看出,PRV 遗传进化出现两个大的遗传分支,呈现明显的地域性。新发变异型和经典型 PRV 在中国 PRV 遗传进化分支上呈现各自独立进化小分支;我国近年分离的貉源和约克夏梗犬源与新发变异型 PRV 则处于同一进化小分支。

关键词: 猪伪狂犬病毒 gB 基因 序列分析

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草莓叶黄素循环关键酶基因VDE和ZEP的克隆与分析

分子植物育种 2016 北大核心 CSCD

摘要:叶黄素循环在逆境胁迫中对植物光系统起着重要的保护作用。紫黄质脱环氧化酶(VDE)和玉米黄质环氧化酶(ZEP)是调控叶黄素循环的关键酶。本研究采用RT-PCR和RACE技术率先从草莓中克隆获得VDE和ZEP基因。VDE基因c DNA全长1 842 bp,ORF为1 467 bp,编码489个氨基酸;ZEP基因c DNA全长2 325 bp,ORF为1 980 bp,编码660个氨基酸。生物信息学分析表明草莓VDE与ZEP基因所编码的氨基酸序列与蔷薇科的苹果、桃和梅等植物的亲缘关系较近。荧光定量分析发现VDE和ZEP基因在草莓根、茎、叶、花、果实中皆有表达,说明二者均为组成型表达基因,并且叶片中基因的表达量最高而根中最低,推测与其在草莓叶黄素循环调控的作用有关。

关键词: 草莓 叶黄素循环 紫黄质脱环氧化酶(VDE) 玉米黄质环氧化酶(ZEP)

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2个再生稻品种机械化生产的产量构成分析

厦门大学学报(自然科学版) 2016 北大核心 CSCD

摘要:为探索再生稻机械化生产的增产途径,在潭香稻谷专业合作社对甬优2640和佳辐占两品种的双季产量及其构成进行分析,结果表明:甬优2640矮秆抗倒,穗大粒密,双季产量分别为(10 598±1 433)和(10 126±1 527)kg/hm2;佳辐占熟期短,适应闽北安全生长期短的气候生态,双季产量分别为(7 006±1 399)和(6 443±1 357)kg/hm2.再生稻产量由单位面积(m2)穗数、每穗粒数、结实率和千粒质量4个因素构成.2个品种的结实率和千粒质量变异小,与产量无显著相关性;单位面积穗数和每穗粒数变异大,与产量呈显著或极显著正相关,且由此二者组成的单位面积总粒数的变异更大,与产量的相关性更高,对增产的贡献率>0.97,是决定产量的主要因素;而单位面积总粒数与单位面积穗数、每穗粒数呈显著或极显著正相关,其中头季与单位面积穗数的相关度更高,再生季与单位面积穗数、每穗粒数的相关度差距不大.因此,提高再生稻机械化生产的产量主攻方向是扩增单位面积总粒数,而扩增单位面积总粒数必先扩增单位面积穗数和每穗粒数,其中头季侧重扩增单位面积穗数,再生季兼顾扩增单位面积穗数和每穗粒数.

关键词: 再生稻 产量构成 相关分析 机械化生产

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‘芙蓉李’转录组SSR信息分析与分子标记开发

果树学报 2016 北大核心 CSCD

摘要:【目的】明确‘芙蓉李’转录组SSR总体特征,开发SSR引物,为李种质资源多样性分析和品种鉴定等奠定基础。【方法】采用MISA分析‘芙蓉李’转录组SSR位点信息,利用Primer3设计引物,并随机选择40对引物对8个李品种进行多态性分析。【结果】在‘芙蓉李’转录组中,共检测到7 601个SSR位点,分布于5 434条Unigene,SSR位点出现频率为54.51%(SSR位点数7 601与大于1 kb的Unigene数13 944的比值)。其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的42.19%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总SSR的37.72%和18.48%。A/T和AG/CT是单核苷酸和二核苷酸的优势重复基元。对7 601个SSR位点设计出4 235对SSR引物。随机选择40对引物进行PCR扩增,其中17对在8个李品种中表现出多态性。【结论】李转录组数据是开发SSR标记的有效来源,开发的SSR标记可为李种质资源遗传多样性分析等提供了丰富的候选标记。

关键词: SSR 转录组

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辣椒EST-SSR标记的开发与验证

福建农业学报 2016 北大核心

摘要:从NCBI数据库下载118 900条辣椒相关EST,对其进行SSR位点搜索,共搜索出3 343条SSR,分布密度为1/17.20kb,共有287种重复基元。在辣椒EST-SSR中,二核苷酸(1 476个SSR)和六核苷酸(1 128个SSR)占主导地位,所占比例分别为44.15%和33.74%;出现最多的重复基元是GA/TC,占总数的14.30%,其次为CT/AG(94个,占8.11%)。针对3 343条含有SSR的EST设计合成了200对引物。用17份辣椒种质对200对引物进行筛选,196对引物有扩增产物,71对引物表现出多态性,共有220个多态性位点。利用71对多态性引物,对特定亲本P181-2-6和P230-2-5及其杂种一代F1的亲缘关系进行检测,结果说明从辣椒相关EST数据库中开发的SSR引物有较好的可用性。

关键词: 辣椒 EST-SSR 标记开发 指纹图谱

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栽培措施对萝卜生长特性及产量的影响

福建农业学报 2016 北大核心

摘要:研究不同栽培措施对萝卜生产的影响,结果表明:试验条件下,播种太早或太迟,对萝卜生长都不利,"瑞雪"萝卜最适播种期应为9月25日至11月5日;利用地膜覆盖,萝卜地上部和地下部的生产速度明显提高,生育期提早,产量比露地提高了36.64%;每667m2种植密度以6 500~7 500株为好。

关键词: 萝卜 栽培措施 生长特性 产量

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不同氮钾施用量对再生稻产量及其构成因素的影响

福建农业学报 2016 北大核心

摘要:以两系杂交稻品种广两优676为材料,研究不同氮钾施用量对再生稻产量及其构成因素的影响。试验结果表明,头季达到最高产量的施氮、钾量分别为23.27、22.99g·m~(-2),相应的产量分别为1 152.9、1 159.0g·m~(-2),达到最佳经济收益的施氮、钾量分别为21.86、19.54g·m~(-2);再生季达到最高产量的施氮量为20.48g·m~(-2),相应产量为622.3g·m~(-2);达到最佳经济收益的施氮量为18.42g·m~(-2)。再生稻对氮素反应更灵敏,缺氮比缺钾减产更严重。在头季,有效穗数、株高均随氮、钾量的增加而提高;而每穗粒数与施氮量按钟形曲线先增后减,与施钾量呈直线相关;结实率随施氮量增加而降低。在再生季,随着促芽氮施用量的增加,有效穗数显著提高,而每穗粒数先升后降;在高氮条件下,结实率也有所降低;千粒重的差异则较小。

关键词: 再生稻 施氮钾量 产量 产量因素

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福建省科技重大科技专项水稻新品种现场观摩会在南繁基地举行

福建稻麦科技 2016

摘要:2016年4月5日,福建省科技重大专项"水稻种质创新及新品种选育"水稻新品种现场观摩会在海南省三亚藤桥福建省南繁基地举行。福建省科技厅副厅长林岿然、院领导陈永共、张伟光、陈世奎莅临现场观摩指导。现场观摩会由谢华安院士主持,福建省科技厅农业科技处、院科研处、党办负责同志以及福建省农科院水稻所、生物所,福建农林大学作物学院,厦门大学等项目承担单位的有关科研人员参加观摩会。现场观摩会上,谢华安院士、杨惠杰

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广叶绣球菌菌丝体与子实体蛋白质营养价值评价

食品科学 2016 北大核心 CSCD

摘要:测定广叶绣球菌(Sparassis latifolia)子实体及不同配方液体培养基中菌丝体的蛋白质和氨基酸含量,采用国际通用的蛋白质营养评价方法对子实体和菌丝体的营养价值进行综合评价。不同液体培养基中菌丝体蛋白质含量为26.8%~30.6%,子实体蛋白质含量为13.4%;玉米粉配方菌丝体第一限制氨基酸为异亮氨酸,面粉、糯米粉配方第一限制氨基酸为含硫氨基酸(蛋氨酸+胱氨酸);子实体必需氨基酸含量为48.62%,高于各液体配方菌丝体,且子实体必需氨基酸指数、生物价最高。借助模糊识别法得出,玉米粉、面粉、糯米粉菌丝体与全鸡蛋蛋白质的贴近度分别为0.94、0.90和0.92,高于子实体。

关键词: 广叶绣球菌 菌丝体 子实体 营养价值

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