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海南稻作区稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异监测与多样性分析

植物保护 2023 北大核心 CSCD

摘要:海南省地处热带。由于具有国内其他地区无可比拟的光温资源优势,每年有大量的水稻材料在南繁区繁育与种植,给稻瘟病菌的变异及传播带来了极大的便利。自20世纪70年代以来,Pik等位基因已被广泛地用作水稻抗稻瘟病育种的主要抗源。为了解海南稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异及多样性,本研究从海南稻作区采集穗茎瘟病样,通过单孢分离获得100株稻瘟病菌株。利用AvrPik基因特异性引物扩增病原菌DNA,所得PCR产物经克隆、测序后与参考序列进行比对分析。结果从100株菌株中鉴定出AvrPik_A、AvrPik_B、AvrPik_D、AvrPik_E和AvrPik_F共5种等位基因类型。其中AvrPik_D类型最多,出现频率为50.00%;其次为AvrPik_E类型,出现频率为32.08%;第三为AvrPik_B类型,出现频率为8.49%。在AvrPik等位基因核苷酸多样性方面,非信号肽区域多样性要明显高于信号肽区域。就群体受到的选择压而言,南繁种植区与常规种植区的稻瘟病菌群体的Ka/Ks值均大于1,分别为2.703 1和1.236 6,表明,无论是南繁区还是常规种植区,AvrPik等位基因均受到了强烈的正选择压,且南繁区群体受到的选择压更强。上述5种不同基因型的代表菌株中菌株20MG48 (AvrPik_F)长势最快,其产孢量却最少。本研究初步明确了海南稻作区AvrPik等位基因的群体结构,为本稻作区抗性品种的布局以及抗瘟育种计划提供参考。

关键词: 稻瘟病菌 AvrPik等位基因 多样性

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基于GC-IMS结合化学计量学分析不同冷冻时长对椰子水挥发性物质的影响

食品工业科技 2023 北大核心 CSCD

摘要:采用气相色谱-离子迁移谱(GC-IMS)和化学计量法,研究了成熟椰子水在-18℃冷冻 0、1、2和 3个月(CW0、CW1、CW2和CW3)后挥发性物质的变化.结果表明:GC-IMS能够从成熟椰子水中鉴定出 29种挥发性有机物,包括 13种醇类、6种酯类、6种醛类、2种酮类、2种酸类物质.经冷冻后,挥发性物质的总量(峰值体积)发生了显著的降低和散失.随着冷冻时间的延长,酸类化合物峰体积逐渐增强并在冷冻第 2个月后达到最大值,而后降低.醇、酯、醛类物质峰体积逐渐上升并在冷冻第三个月后达到最大值,酮类物质峰体积逐渐降低,并在冷冻 2个月之后达到最小值.主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)均能在不过拟合的情况下对 4种椰子水进行判别;进一步从鉴定出的挥发性物质中,根据可变重要性投影(VIP)值>1选取9个关键标志物,在聚类热图分析中分别实现对 4种椰子水的聚类和有效区分,其中乙酸乙酯(D、M)、异丁醛、乙醛、己酸乙酯、2-丁酮、乙酸(M)可作为椰子水不同冷冻时长的阶段标志物.研究结果为不同冷冻时间下椰汁的GC-IMS快速鉴别提供了依据.

关键词: 椰子水 冷冻 挥发性物质 气相色谱-离子迁移谱(GC-IMS)

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基于卡尔曼滤波算法的菠萝育苗光照强度监测系统

中国农机化学报 2023 北大核心

摘要:在菠萝育苗过程中,为降低光照强度监测误差及滞后性,设计基于卡尔曼滤波算法的光照强度监测系统.在构建LoRa无线通讯、嵌入式数据采集终端的基础上,开发具有显示、存储功能的可视化、在线监测软件界面,并提出卡尔曼滤波模型.通过对比试验,得出卡尔曼滤波模型优于加权递推平均滤波模型,其平均绝对误差不超过0.13%、均方根误差不超过0.16%、滞后时间不大于1s.结果表明,该监测系统具有较低的误差和滞后性,对菠萝育苗的光照精准调控具有指导意义.

关键词: 菠萝育苗 光照强度 监测系统 卡尔曼滤波

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橡胶树胶乳HbHSP90.6基因克隆、表达与亚细胞定位分析

热带作物学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:HSP90是维持细胞内稳态的关键成分,其通过调节其底物的成熟、稳定性、活性和翻转来控制多个细胞过程。橡胶树(Hevea brasiliensis Müll. Arg.)是生产天然橡胶的重要来源,其拥有数千种工业用途,具有较高的社会经济价值。利用PCR技术从橡胶树品种热研73397胶乳中克隆1个HSP90家族成员基因,命名为HbHSP90.6基因(GenBank登录号:OP375588),序列分析表明其编码区(CDS)为2112 bp。理化性质分析表明其相对分子量为80 774.85 Da,等电点为5.04,不稳定系数为38.98,总平均亲水性为-0.610,推测HbHSP90.6蛋白是一个稳定的亲水蛋白。保守结构域分析和多序列比对结果显示,HbHSP90.6含有1个PTZ00272的结构域和包含高度保守的MEEVD基序,属于HSP90家族成员。进化分析结果显示,HbHSP90.6与拟南芥AtHSP90.1(NM_124642.4)和水稻OsHsp90-1(LOC_Os04g01740)聚在一起,同源性分别为92.34%和86.44%。组织表达分析显示:HbHSP90.6基因在胶乳中的基因表达量显著高于根、花、枝、茎、叶,HbHSP90.6基因在胶乳中的表达量相对于花达到283倍,推测HbHSP90.6基因可能参与乳管胞内运输和胶乳代谢调控;胶乳中的伤害处理显著上调HbHSP90.6基因的表达,是处理前的19倍,推测HbHSP90.6基因参与机械伤害调控的橡胶树生理与代谢活动反应;HbHSP90.6基因在植物激素乙烯利、茉莉酸处理和吲哚-3-乙酸处理的6 h时表达量均达到最高,分别是处理前的45倍、17倍和6倍;在油菜素内酯处理后的12 h时,HbHSP90.6基因表达量显著上调表达,达到处理前的50倍,推测HbHSP90.6基因参与植物激素介导的转录调控。通过构建35S::HbHSP90.6::GFP融合表达载体进行亚细胞定位,结果显示HbHSP90.6基因定位在细胞质和细胞核中,与亚细胞定位预测结果一致。该研究结果为阐明HbHSP90.6基因在植物激素信号调控的橡胶树逆境胁迫和胶乳代谢分子机制研究奠定坚实基础。

关键词: 橡胶树 HbHSP90.6 油菜素内酯 表达分析 亚细胞定位

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基于归一化植被指数获取环境因子权重的土壤管理分区方法

农业工程学报 2023 EI 北大核心 CSCD

摘要:在基于加权环境变量进行土壤管理分区时,常利用作物产量与环境变量之间的关系来获取环境变量的影响权重。然而,当作物产量难以获取或作物产量与环境变量之间不能建立关系模型时,这种基于作物产量获取环境变量影响权重的方法将不再适用。针对此问题,该研究基于归一化植被指数(normalized difference vegetation index,NDVI)可以反映土壤条件而土壤条件又受环境变量影响,提出一种利用NDVI获取环境变量影响权重的方法,并将其应用于橡胶园土壤管理分区。结果表明,利用该方法可以筛选出与NDVI关系紧密的15个关键环境变量,并且可以获取这些环境变量的权重,其中,前5个环境变量(坡向正弦和余弦,地形位置指数,地形湿度指数,剖面曲率)的权重几乎占到15个环境变量权重之和的一半。利用加权后的环境变量可将研究区橡胶园划分为6个分区。这些分区可以很好地区分不同土壤养分(土壤有机质、全氮、有效磷和速效钾)的丰缺水平。同时,不同分区间环境变量的差异也达到了显著水平(P<0.05)。可见,该研究提出的利用NDVI获取环境变量影响权重的方法是可靠的。研究可为土壤管理分区提供可靠的思路。

关键词: 聚类 土壤 环境 管理分区 影响权重 橡胶园

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基于ICP-MS的不同产地橡胶籽无机元素含量差异分析

中国无机分析化学 2023 北大核心

摘要:为进一步拓展农业废弃物——橡胶籽的开发价值,通过微波消解结合电感耦合等离子体质谱仪(ICP-MS)建立了快速分析橡胶籽中 16 种无机元素的方法,测定了我国六个产地橡胶籽中 16 种元素的含量,通过无机元素指纹图谱、主成分分析和聚类分析来筛选其特征元素,进行差异性分析.结果表明,各元素线性关系良好(r>0.999),检出限在 0.000 7~0.53 mg/kg,加标回收率在 86.0%~96.3%,精密度符合规定(RSD<10%),所建立的方法可用于橡胶籽中多元素的快速检测;橡胶籽中均含有较丰富的无机元素,Mg 含量最高,均在 10 g/kg 以上;K 含量达 4 000~9 122 mg/kg;Ca 含量达 382~1 433 mg/kg;Zn含量在 300 mg/kg以上;Ti、Cu、Mn、Ni 含量也均在 100 mg/kg 以上;有害重金属 Pb、Cd含量较高,橡胶籽在食用产品开发过程需注意控制.不同产地橡胶籽元素相对含量的变化趋势在一定程度上基本一致,有部分元素的不同产地相对含量存在一定差异.主成分分析选出前 4 个主成分(Co、V、Cu、Se、Ti、Pb、Cr)的累计方差贡献率为 82.69%,得出特征无机元素为 Co、V、Cu、Se、Ti、Pb、Cr;聚类分析可将 18 个橡胶籽样品分为四大类,说明无机元素的含量与环境、地域等因素具有相关性.研究结果可为橡胶籽的开发利用提供研究基础.

关键词: 橡胶籽 产地 电感耦合等离子体质谱法(ICP-MS) 特征元素

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中国南瓜MLO基因的鉴定与表达分析

江苏农业科学 2023 北大核心

摘要:MLO蛋白是植物特有的一类蛋白家族,其部分成员是植物感染白粉病的必要因子,其功能的缺失突变可诱导植物对白粉病病菌产生广谱且持久的抗性。为了揭示中国南瓜MLO基因的结构特点、系统发育关系及其功能特点,以已知的中国南瓜基因组信息为基础,采用生物信息学方法对中国南瓜的MLO基因进行鉴定分析。结果表明,中国南瓜基因组中含有20个MLO(CmoMLO)基因,分布在14条染色体上。中国南瓜CmoMLO基因大小从2 965 bp到9 967 bp不等,这些基因所编码的蛋白质氨基酸序列长度从324到1 264个不等。对应的等电点为6.26~9.63,分子权重为36 403.18~140 267.57 ku,外显子个数为6~22个。20个CmoMLO基因编码的蛋白质氨基酸序列含有2~8个不等的跨膜区。系统进化分析显示,20个中国南瓜CmoMLO蛋白被分为6个分枝,其中CmoMLO4、CmoMLO8、CmoMLO13、CmoMLO18、CmoMLO19这5个被划分到第Ⅴ分支。通过抗感材料接种后不同时期取样,分析位于第Ⅴ分枝的MLO基因的表达量差异,结果表明,CmoMLO4、CmoMLO13和CmoMLO19可能是参与白粉病病菌侵染中国南瓜的重要相关基因,且接种后24 h是MLO基因参与白粉病侵染的关键时期。本研究结果可为后期中国南瓜抗白粉病材料的创制与挖掘提供参考。

关键词: 中国南瓜 MLO基因 生物信息学 白粉病 抗性

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红棕象甲幼虫对吡虫啉敏感性测定及中毒行为学反应

山西农业大学学报(自然科学版) 2023 北大核心

摘要:[目的]本文旨在明确红棕象甲幼虫对吡虫啉的敏感性及其中毒后的行为学反应.[方法]采用经口注射法,研究了吡虫啉处理对红棕象甲高龄幼虫的致死中剂量和致死中时间,并分析了经药剂处理后红棕象甲的形态学变化.[结果](1)在供试剂量下,吡虫啉对红棕象甲幼虫的致死中时间(LT50)无显著差异,随供试时间延长,致死中剂量(LD50)呈现降低趋势,其中在处理后96 h的LD50为每头0.43 μg.(2)在每头25 μg剂量吡虫啉处理后10~11 min,红棕象甲幼虫丧失活动能力,而在每头62.5~500 μg剂量处理中,试虫丧失活动能力的时长介于1~30 min.(3)吡虫啉处理后红棕象甲幼虫的毒理学症状随处理时间延长依次主要表现为:虫体蜷缩、皱缩、抖动、口器持续大张、体壁松软、体壁僵硬、平衡感缺失后恢复等,其中抖动、口器持续大张、体壁僵硬等现象随时间的延长会反复交替出现.除口器持续大张状态外,其余各状态的出现频率的最高值和最低值均在处理后48 h出现.(4)高剂量下个别试虫会出现内容物崩出的现象,且高剂量会更快的完成各毒理学症状的表现.(5)在经过重新喂食后,部分中毒反应出现缓解,其中以口器持续大张状态在喂食后24 h缓解最为明显.[结论]吡虫啉对红棕象甲的LT50与供试剂量大小无明显相关性.经吡虫啉处理后,红棕象甲幼虫出现明显的中毒反应,同时在经过重新饲喂取食后,部分症状会有所缓解.

关键词: 吡虫啉 红棕象甲 胃毒活性 行为学反应

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三角梅种质自然结实性及种子萌发特性

分子植物育种 2023 北大核心 CSCD

摘要:本研究对位于海南儋州资源圃内的54份三角梅种质,在自然授粉条件下的结实及种子萌发情况进行调查研究和统计分析.结果表明:(1)总体上三角梅自发结实率很低,但不同种质结实性存在较大差异,其中二倍体光叶三角梅遗传背景的品种相对高,筛选出结实量最大的Ⅰ级品种'FormS1A'1个、Ⅱ级品种'Sanderiana'等5个;(2)三角梅的自然结实率在不同季度内存在显著性差异,第一季度结实率最高,为授粉最佳时期;(3)三角梅种子萌发率较高,可达82.70%~91.76%,但自然授粉的种子后代存在9.10%~30.47%的白化苗;(4)三角梅种子可常温储藏至1年,但3个月后发芽率显著降低.研究结果为开展三角梅的实生选育和杂交育种,尤其在优化育种技术及利用遗传材料方面,提供了参考信息.

关键词: 三角梅 结实率 萌发率 白化率

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热带水稻种质资源全生育期耐盐性鉴定与评价

南方农业学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:[目的]明确热带水稻种质资源全生育期耐盐性鉴定的适宜浓度和关键指标,筛选耐盐热带水稻种质资源,为开展热带水稻耐盐机制研究和品种选育提供理论依据.[方法]设盐(NaCl)浓度为0(CK)、0.3%和0.6%3个处理,对23份参试水稻种质资源进行全生育期盐胁迫试验,选用9个耐盐指标,采用多元统计分析方法开展全生育期耐盐性鉴定与评价.[结果]方差分析和相关分析结果显示,0.6%NaCl胁迫下热带水稻种质资源的成活率、单株穗数、主穗总粒数、千粒重和单株产量显著低于CK(P<0.05,下同),丙二醛和钠含量显著高于CK,大多数耐盐指标间存在显著或极显著(P<0.01)相关性,指标间联系较紧密,因此确定热带水稻全生育期耐盐性鉴定的适宜NaCl浓度为0.6%.采用主成分分析法对参试热带水稻种质资源耐盐性综合评价值(D)进行排序,其中有6份热带水稻种质资源(ST007、W25S/ST003、ST017、ST018、ST019和ST020)的D值在0.70以上,耐盐性较强.根据D值进行聚类分析,可将参试热带水稻种质资源划分为三大类群,筛选出6份耐盐性较强的热带水稻种质资源,聚类结果与D值排序基本一致.不同类群热带水稻种质资源的耐盐性主要表现为成活率、单株穗数、单株产量和主穗总粒数的差异,进一步的逐步线性回归分析结果表明,主穗总粒数、成活率和单株穗数可作为热带水稻全生育期耐盐性评价的关键指标.[结论]热带水稻全生育期耐盐性鉴定的适宜NaCl浓度为0.6%;筛选出主穗总粒数、成活率和单株穗数3个关键指标建立回归方程用于热带水稻全生育期耐盐性评价;获得6份耐盐性较强的热带水稻种质资源,分别为ST007、W25S/ST003、ST017、ST018、ST019和ST020.

关键词: 热带水稻 全生育期 耐盐性 主成分分析 聚类分析

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