科研产出
中国明对虾基因组串联重复序列分析
《科学通报 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：串联重复序列包括微卫星和小卫星重复序列,前者的重复单位长度为1~6bp,后者的重复单位长度在7bp以上.通过对中国明对虾884kb总长度的随机基因组DNA序列的分析,从中共找到了2159个串联分布的重复序列,其中微卫星序列1714个,占总重复序列的79.4%,小卫星序列445个,占总重复序列的20.6%.这些重复序列的总长度为116685bp,占总序列的比例为13.2%,其中微卫星序列长度占9.78%,小卫星序列长度占3.42%.依据重复序列数目的多少,前20种重复序列类型依次是:AT(557个)、AC(471个)、AG(274个)、AAT(92个)、A(56个)、AAG(28个)、ATC(27个)、ATAG(27个)、AGG(18个)、ACT(15个)、C(11个)、AAC(11个)、ACAT(11个)、CAGA(10个)、AGAA(9个)、AGGG(7个)、CAAA(7个)、CGCA(6个)、ATAA(6个)、AGAGAA(6个).其中两碱基重复序列,无论是在数目还是在序列长度上,都占有绝对的优势,而五碱基重复序列的数目和种类都很少,只发现了AGAGA,GAGGC,AAAGA3种;同时发现由7,11,13等数学上称为质数的长度重复单位所组成的重复序列的数目和种类都要比其两边的重复序列的种类和数量要少.
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人工标志放流中华鲟幼鱼的降河洄游
《水生生物学报 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：1998— 2 0 0 2年期间 ,向长江放流人工繁殖中华鲟 2月龄稚鲟 (全长 7 5— 17 0cm) 17 5 2万尾 ,其中 7795 7尾用CWT进行标记 ;14月龄幼鲟 (全长 5 5 0— 98 0cm) 4 0 0尾 ,全部用外挂银牌和CWT双重标记。放流后沿长江及沿海收集中华鲟稚鲟和幼鲟样本 ,4年共回收稚鲟样本 6 4 0 0尾 ,幼鲟样本 13尾 ,检测到携带标记的稚鲟和幼鲟各 13尾。人工放流的幼鲟降海洄游的速度平均达到 2 8 6km/ 2 4h(7 1— 10 0 2km/ 2 4h) ,回捕时离放流点的距离从 346—2 4 5 9km ,平均 16 0 0km ,回捕的标志幼鲟有 4 6 2 %的个体来自海区。初步估算出 1999年和 2 0 0 0年人工放流个体在长江口幼鲟种群中的贡献率分别为 2 2 81%和 0 997%。结果表明 ,人工放流中华鲟稚鲟和幼鲟的生长、洄游及分布与自然种群没有明显差异。放流较大规格的幼鲟有利于提高成活率 ,而目前长江中华鲟种群的补充仍以自然繁殖种群为主。
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牙鲆自然杀伤细胞增强因子(NKEF)全长CDNA的克隆及表达分析
《高技术通讯 》 2005 EI 北大核心 CSCD
摘要：采用快速扩增CDNA末端(RAPID AMPLIFICATION OF CDNA ENDS,RACE)的方法,分离和测定了牙鲆自然杀伤细胞增强因子(NKEF)CDNA的全长核苷酸序列,5''RACE扩增分离得到了400BP左右的片段,3''RACE扩增得到了800BP左右的片段,经过拼接得到了牙鲆NKEF全长CDNA序列.牙鲆NKEF CDNA全长1028BP(不包含POLYA),其中包括67BP的5''非翻译区、597BP的开放阅读框和364BP的3''非翻译区(不包含POLYA),整个开放阅读框编码198个氨基酸.RT-PCR分析表明,NKEF基因在牙鲆不同组织中普遍表达,但是表达水平存在着明显的差异.研究结果为提高牙鲆自身免疫防御能力的研究提供了理论依据.
关键词： 牙鲆 自然杀伤细胞增强因子 快速扩增 CDNA 末端 CDNA
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东海浮游翼足类(pteropods)种类组成和多样性研究
《生物多样性 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：根据 1997-2000年东海 23°30′-33°00′N、118°30′-128°00′E海域四季调查资料,运用定量、定性方法探讨了东海浮游翼足类种类组成、种类数、物种多样性指数(H′)及其与环境因子的关系。结果表明:四季中共出现翼足类 21种,其中尖笔帽螺 (Creseisacicula)、马蹄螔螺 (Limacinatrochiformis)、强卷螺 (Agadinasyimpsoni)、蝴蝶螺(Desmopteruspapilio)、锥笔帽螺(C. virgulavar. comica)、棒笔帽螺(C. clava)、玻杯螺(Hyalocylizstriata)、长吻龟螺(Cavolinialongirostris)、芽笔帽螺 (Creseisvirgula)和拟海若螺 (Paraclionelongicaudata)等 10种为常见种,胖螔螺(Limacinainflata)和皮鳃螺(Pneumodermaatlanticum)等两种为次常见种,其余 9种是稀有种。在春季转至夏季、冬季转至春季时,种类组成出现明显的季节更替现象;冬春季种类分布仅受温度变化的影响,而夏秋季则受温度和10m层或底层盐度变化的共同影响。在冬春季,东海近海由于暖流势力较弱,水温较低,翼足类种数较少,种类数和多样性指数南部大于北部,外海大于近海;从夏季到秋季随着台湾暖流势力的加强,海流将较多的种类带到东海北部和近海,尽管近海种数和多样性指数值仍呈南高北低的特征,但南部和北部,近海和外海的差距明显缩小。
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牙鲆胚胎玻璃化冷冻技术研究
《高技术通讯 》 2005 EI 北大核心 CSCD
摘要：对名优经济鱼类牙鲆(PARALICHTHYS OLIVACEUS)胚胎的玻璃化冷冻技术方法进行了研究.筛选出了适合于牙鲆胚胎平衡和培养的基础液BS2,对牙鲆不同时期胚胎在玻璃化液VS2中的耐受能力进行了研究,随着平衡时间的延长,胚胎成活率逐渐降低,4-5对肌节期、16-20对肌节期、尾芽期表现出对玻璃化液较强的适应能力.对洗脱液的种类和浓度进行了筛选,结果显示0.125MOL/L蔗糖洗脱成活率最高.在室温(21~22℃)和6℃下分别对牙鲆不同时期胚胎在VS1中的成活率进行了比较研究,结果显示出15-20对肌节期在室温下的成活率高于低温,其它时期胚胎低温下的成活率高于室温.利用VS4、VS2、VS3分别对牙鲆尾芽期、肌效应期、出膜前期胚胎进行玻璃化冷冻保存,取得了5粒成活胚,4粒孵化出膜,成活时间为14~67H.
关键词： 牙鲆(PARALICHTHYS OLIVACEUS),胚胎,玻璃化,冷冻保存
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大菱鲆红体病虹彩病毒ATPASE基因的克隆与序列分析
《高技术通讯 》 2005 EI 北大核心 CSCD
摘要：克隆了大菱鲆红体病虹彩病毒(TRBIV)的重要功能蛋白-腺苷三磷酸酶(ADENOSINE TRIPHOSPHATEASE, ATPASE)基因的全部编码区及其上下游部分的核苷酸序列.经多序列比对和分析发现,TRBIV与GENBANK中6种代表性虹彩病毒的同源性介于35%~98%之间.绘制出的包含TRBIV在内的14种虹彩病毒的系统发育树证实,TRBIV是一种新的鱼类虹彩病毒,其分类地位处在虹彩病毒科待指定病毒属内的真鲷虹彩病毒亚群和传染性脾肾坏死病毒亚群之间.
关键词： 大菱鲆 病毒病 大菱鲆红体病虹彩病毒 腺苷三磷酸酶
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病毒:海洋生态动力学和疾病学研究的创新点
《海洋湖沼通报 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：病毒在海水中的浓度为107～109个/mL,多种多样的海洋病毒几乎对所有的海洋生物都有影响,5%～40%的海洋生物是被病毒销毁的,近30%海洋蓝藻和60%游离异养菌的死亡与病毒有关。地球26%的碳循环经海洋病毒完成。病毒可以影响许多生物地球化学过程和生态学过程,包括营养物循环、颗粒大小分布和沉积率、细菌和藻类的多样性和物种分布、赤潮控制、全球气候变化和种间基因转移。各种生物种群内和种群间有机会充分接触,为病毒传播及变异创造了条件,使海洋系统成为极富多样性的原始病毒库,除了对海洋细菌、蓝细菌、真核藻类、浮游生物等重要海洋初级生产力和次级生产力相关的种群的感染而影响整个海洋生态系以外,病毒还导致海水养殖品种发生多种病毒性疾病,病毒生态学特征对海洋生物疾病的发生和流行起着十分关键的影响作用。虽然国际上海洋病毒研究取得了重要的研究进展,但与海洋病毒的实际作用相比,研究还只是初现端倪,学科具有广阔的发展空间。
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