科研产出
茶树鸟苷酸交换因子CsRopGEF1和CsRopGEF3基因的克隆及表达特性
《植物资源与环境学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：从茶树[Camellia sinensis (Linn.) O. Ktze.]品种‘龙井长叶’(‘Longjingchangye’)叶片中克隆获得鸟苷酸交换因子RopGEF的编码基因CsRopGEF1和CsRopGEF3;用生物信息学方法分析了这2个基因编码的氨基酸序列的同源性及理化性质;并用qRT-PCR研究了CsRopGEF1和CsRopGEF3基因在茶树不同组织中的表达模式及其对外源ABA处理的响应模式。结果显示:茶树CsRopGEF1和CsRopGEF3基因全长分别为1 844和1 509 bp,分别包含长度1 731和1 434 bp的开放阅读框,各编码576和477个氨基酸。茶树CsRopGEF1和CsRopGEF3基因编码的氨基酸序列均含有保守的PRONE结构域,其中均包含保守基序Motif 1至Motif 7;分子式分别为C2797H4402N762O856S32和C2356H3696N648O752S29,理论相对分子质量分别为63 420和54 060,理论等电点分别为p I 6. 69和p I 5. 10,不稳定系数均大于40,亲水性平均系数分别为-0. 368和-0. 552,并存在多个磷酸化位点,以丝氨酸磷酸化位点最多,表明这2个基因编码的氨基酸序列均属于不稳定的酸性、亲水性蛋白,且其功能可能受磷酸化调控。茶树CsRopGEF1和CsRopGEF3基因编码的氨基酸序列与水稻(Oryza sativa Linn.)等植物的RopGEF1和RopGEF3氨基酸序列的相似度均在75%以上,且与双子叶植物同类氨基酸序列的同源性较高,而与单子叶植物同类氨基酸序列的同源性较低。qRT-PCR分析结果显示:茶树CsRopGEF1基因的相对表达量在茎中最高、叶片中最低,且差异显著(P<0. 05);而CsRopGEF3基因的相对表达量在根和茎中均较高,且均显著高于叶片,表明CsRopGEF1和CsRopGEF3基因表达存在组织特异性。经100μmol·L-1外源ABA处理后,茶树CsRopGEF1基因的相对表达量整体显著下调,而CsRopGEF3基因的相对表达量则整体上调,说明这2个基因对外源ABA的响应模式存在差异。根据研究结果,推测茶树CsRopGEF1和CsRopGEF3基因在ABA信号转导途径中受不同的调控作用,且可能在茶树根和茎的生长发育中发挥重要作用。
关键词： 茶树 RopGEF基因 理化特性 同源性 表达特性
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桑黄子实体醇提物对SW620结肠癌细胞的抑制作用
《菌物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为评价桑黄Sanghuangporus sanghuang子实体醇提物对SW620结肠癌细胞的影响,用alamarBlue?法测定细胞增殖率,用流式细胞术碘化丙啶(propidim iodide,PI)染色法和2′,7′-dichlorofluorescin diacetate (H2DCFDA)染色法分别检测细胞早期凋亡率、细胞周期变化和活性氧(reactive oxygen species,ROS)释放量,结果表明桑黄子实体醇提物在12.5–100μg/mL作用浓度下具有抑制SW620细胞增殖的作用,但对中国仓鼠卵巢(Chinese hamster ovarycell,CHO)细胞和小鼠骨髓巨噬细胞的增殖无显著抑制作用;桑黄子实体醇提物能诱导SW620细胞凋亡,引起细胞周期变化,可降低G0/G1和G2/M期细胞数量,并呈现浓度梯度依赖性,ROS实验结果提示桑黄子实体醇提物的促肿瘤细胞凋亡与ROS释放相关。
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鸡源细菌中5种四环素耐药基因多重PCR检测方法的建立
《食品与机械 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为建立一种同步检测鸡源细菌中5种四环素耐药基因tetA、tetD、tetG、tetS和tetX的多重聚合酶链式反应(PCR)方法,优化了多重PCR体系的引物和Taq DNA聚合酶浓度及退火温度等参数,并考察了方法的灵敏度、特异性和适用性。建立的多重PCR反应技术的最佳反应体系为:混合DNA模板5μL,Taq酶1μL,tetA和tetX的正反向引物各0.5μL,tetG、tetD和tetS的正反向引物各1.0μL,dNTP4μL,MgCl24μL,10×PCR反应缓冲液5μL,最终用dd H2O补齐至50μL;反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,35个循环;72℃延伸10min。该方法的灵敏度为102 CFU/mL,且能广谱地检测多种鸡源细菌中的5种四环素耐药基因。与传统的单重PCR方法相比,该多重PCR技术快速高效、适用性广。
关键词： 鸡源细菌 四环素耐药基因 多重聚合酶链式反应 快速检测
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黄芪颗粒对DON致BALB/c小鼠免疫损伤的保护作用
《中国兽医科学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为探讨黄芪颗粒对脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)致BALB/c小鼠免疫抑制的保护作用,将48只BALB/c小鼠随机均分为空白对照组、黄芪对照组、DON组和黄芪-DON组。黄芪对照组和黄芪-DON组提前1周在饮水中添加黄芪颗粒(0.02 g/mL),连续5周;DON组和黄芪-DON组灌喂DON 2.4 mg/(kg·d),连续28d。每天观察体质量、采食量、脏器系数、病理组织学、血液学指标等的变化;采用ELISA试剂盒测定血清IL-1β、IL-2、IFN-γ、TNF-α、TGF-β水平变化,用实时荧光定量PCR检测上述细胞因子基因mRNA的表达,并采用流式细胞术检测脾CD4~+、CD8~+、CD3~+、CD19~+T细胞。结果显示,黄芪-DON组的体增重、采食量和脾系数显著高于DON组(P<0.05),肝系数、肾系数显著减小(P<0.05);通过病理组织切片观察,发现黄芪-DON组肝、肾的病变程度明显低于DON组;黄芪-DON组CD4+/CD8~+、CD19~+和血清IL-2、TNF-α、IFN-γ、TGF-β水平均显著高于DON组(P<0.05),脾中IL-2、IFN-γ、TGF-β基因mRNA的表达量也显著高于DON组(P<0.05)。结果表明,黄芪颗粒能明显减轻DON所致肝、肾损伤,缓减DON诱导的免疫抑制,可显著提升机体的免疫水平。
关键词： 脱氧雪腐镰刀菌烯醇 黄芪 BALB/c小鼠 免疫毒性
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水稻簇生穗基因CPB4的精细定位
《复旦学报(自然科学版) 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：本研究鉴定了一个穗型突变体T637,表现为簇生穗型,穗粒数减少,结实率降低,籽粒变小,千粒重下降.遗传分析发现穗型突变由隐性单基因控制;通过基因芯片检测和SSR标记分析最终将目标基因定位在第4号染色体标记RM2439和RMZL74之间1.3 Mb范围内.随后通过全基因组重测序,发现突变体中LOC_Os04g39430基因第4外显子上有一段4 262 bp序列插入,因此确定其为候选基因,并命名为CPB4(CLUSTERED PRIMARY BRANCH 4).通过分析亚洲栽培稻特青(O.sativa L.)和T637对不同浓度24-epiBL(24-表油菜素内酯)的敏感程度,确认T637为油菜素内酯敏感型突变体.qRT-PCR分析表明,突变体T637中BR生物合成相关基因D2和BRD2以及BR信号转导相关基因BRI1,OsBAK1,OsLIC1,TUD1,BU1在幼穗中的表达量均显著降低.
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都市农业发展地区农民收入结构演变规律及其启示——基于上海、北京、广州2005-2014年数据比较
《上海农业学报 》 2018 CSCD
摘要：为了解近年来都市农业发展地区农民收入结构变化情况,并为相关部门的政策研究提供科学依据,以北京、上海、广州为代表,对2005-2014年都市农业发展地区的农民收入结构演变规律及特点进行了分析。结果表明,转移性和财产性收入是目前农民收入的第二大来源,且其增速逐年上升,未来可能取代工资性收入成为农民收入的主力;家庭经营性收入占农民纯收入的比重降幅收窄,今后可能成为增加农民纯收入的重要途径。各都市农业发展地区的不同点是:北京受经济发展速度和相关农业政策措施的影响,工资性、转移性和财产性收人增长较快;上海因工资性收入增长减速,农民纯收入增速总体明显减缓;广州因农业生产总值较大,农民家庭经营性收入所占比重明显高于北京和上海,但2014年受房地产调控政策影响,转移性和财产性收入变动较大。
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母猪繁殖性能相关5个候选基因的PCR-RFLP多态性研究
《上海农业学报 》 2018 CSCD
摘要：为了比较ESR、NCOA1、ADAMTS1、FUT1和RBP4基因对猪繁殖性能的效应大小,采用PCR-RFLP技术,分别检测了杜洛克、长白和大白群体内5个基因的基因型频率和等位基因频率,并分析不同基因型与3个猪群体的总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和出生窝重(BLW)相关性。结果表明:对猪繁殖性能影响效应最大的是NCOA1和RBP4基因,其次是FUT1和ADAMTS1基因,最小的是ESR基因。NCOA1基因在杜洛克和大白群体内AA型的NBA比BB型的分别高1.11和1.92头,AA型的TNB比BB型的分别高1.18头和0.53头。RBP4基因在3个猪群体内AA型的TNB比BB型的高0.53—0.86,在杜洛克和大白群体内AA型的NBA比BB型的分别高1.1头和1.29头。FUT1在杜洛克和大白群体内AA型的TNB比CBB型的分别高0.47和0.56),AA型的NBA比BB型的分别高0.76头和1.06头。ADAMTS1基因在3个猪群体内AB型的TNB比AA型的高0.67—0.88,AB型的NBA比AA型的高0.54—0.86。在大白群体内ESR基因的BB型的TNB、NBA比AA型的分别高0.36头和0.41头。5个基因的不同基因型对3个猪群体BLW影响不显著。
关键词： 繁殖性状 雌激素受体(ESR) 核受体辅激活蛋白1(NCOA1) 含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶1基因(ADAMTS1) 岩藻糖转移酶1基因(FUT1) 视黄醇结合蛋白4基因(RBP4)
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百合体胚诱导、发育及不同组织实时定量PCR内参基因筛选
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：本研究筛选观赏百合(Lilium oriental×Trumpet hybrid)体胚诱导、发育不同时期及不同组织中稳定表达的内参基因,以观赏百合品种‘Conca D'Or’为研究对象,采用实时荧光PCR分析百合8个候选内参基因(18S,ɑ-TUB,GAPDH,UBQ,b HLH,ACT,EIF,EF1)在体胚诱导不同时期、体胚发育不同阶段及不同组织中的扩增效果,并采用Genorm、Norm Finder和Best Keeper三种软件对候选内参基因在百合中的表达稳定性进行综合评价。结果表明:b HLH在体胚诱导、发育及不同组织中的稳定性优于其他基因;GAPDH及ACT在观赏百合‘Conca D'Or’上扩增效果差。将体胚诱导不同时期、体胚发育不同时期及不同组织的扩增数据放在一起分析,Ge Norm和Norm Finder软件评估最适内参基因为b HLH和EIF,Best Keeper软件评估最适内参为EF1和b HLH。本研究建立了观赏百合实时荧光定量PCR内参基因的筛选体系并选出观赏百合体胚诱导、发育及不同组织表达最稳定的前三个内参基因分别为b HLH、EIF和EF1。
关键词： 百合 内参基因 实时荧光定量 PCR 体细胞胚胎
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