科研产出
基于转录组测序技术分析猪德尔塔冠状病毒感染ST细胞机制的初步研究
《中国预防兽医学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）感染可导致仔猪出现水样腹泻和死亡，严重危害猪的健康。为研究PDCo V感染引起宿主细胞基因转录水平的变化及初步研究其感染机制，本研究提取PDCo V感染组和不感染该病毒的阴性对照组ST细胞样品总RNA，构建二者的cDNA文库后采用Illumina HiSeq 6000高通量测序平台进行转录组测序（RNA-Seq）。结果显示，所有样品的测序错误率均≤0.03%;Q20/%和Q30/%分别达98%和94%以上；GC含量在51.09%～55.15%；相关性分析结果显示，阴性对照组及感染组细胞样品各组内的R值均＞0.9，上述结果表明测序数据可靠，可用于后续转录组学数据分析。采用ggplot2软件分析两组细胞组内测序结果的相关性，并以相关系数R＞0.9判定各组内测序数据的准确性；采用DESeq2软件并以P＜0.05和log2（Fold change）＞1为条件筛选两组细胞中转录显著差异基因；采用ClusterProfiler R软件对转录显著差异基因进行GO功能和KEGG信号通路的富集分析；采用Pheatmap软件对各组ST细胞中与免疫反应相关的转录显著差异基因进行聚类分析；随机选择9个转录显著差异基因经RT-q PCR验证RNA-Seq的结果。筛选结果显示，与阴性对照组细胞相比，共筛选出5 719个转录显著差异基因，其中3 573个转录显著上调基因，2 146个转录显著下调基因。GO功能和KEGG信号通路富集分析结果显示，转录显著上调的基因与ST细胞的免疫应答、防御反应等功能有关；转录显著下调的基因与细胞的氧化还原和新陈代谢等功能有关；转录显著上调的基因参与细胞因子受体互作、天然免疫反应相关、肿瘤坏死因子等的信号通路；转录显著下调的基因与细胞物质代谢信号通路有关，包括氨基酸代谢、脂代谢、乙醛酸和二羧酸代谢等信号通路。与免疫反应相关的转录显著差异基因的聚类分析结果显示，与阴性对照组细胞相比，PDCo V感染的ST细胞中白细胞介素基因（IL-1R1、1L-6、IL-10RB、IL-15和IL-12A等）、抗病毒基因（MX1、OAS）和干扰素基因（INFAR1、IFN-ALPHAOMEGA）的转录水平均显著上调。上述结果表明PDCo V感染后，ST细胞的天然免疫反应被激活，但细胞的代谢反应降低，这更有利于减弱病毒在ST细胞中的复制，起到一定的抗病毒效果。9个转录显著差异基因的RT-q PCR结果与RNA-seq结果基本一致，表明转录组测序数据可靠。本研究为进一步解析PDCo V的感染机制提供参考依据。
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红彩瑞猎蝽微胶囊人工饲料饲养效果评价
《植物保护 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为开展红彩瑞猎蝽的人工规模化繁育，研制了一种以自然猎物血淋巴为主，烟草汁液为辅的微胶囊人工饲料，并对其性状和饲养效果进行了评价，以面包虫饲养的猎蝽作对照。结果表明，人工饲料微胶囊成品率73.17%,含水率92.35%,综合感官评定86.8分。取食微胶囊的红彩瑞猎蝽若虫发育历期均显著长于对照，若虫的存活率、体重均显著低于对照，随龄期的增长与对照差异的显著性逐渐减小；处理组成虫获得率16.7%,对照68.9%;成虫产卵前期显著长于对照，但产卵量和卵孵化率无显著差异。猎物斜纹夜蛾幼虫密度为8头/皿时，微胶囊饲养的红彩瑞猎蝽的捕食量显著低于对照，但在较低猎物密度时无显著差异。此种人工饲料能基本满足红彩瑞猎蝽的生长发育，可在一定程度上替代面包虫。
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成都假单胞菌处理畜禽养殖污水的效果研究
《环境科学与技术 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：成都假单胞菌WD211是一株从养殖污水中筛选得到的具有良好脱氮性能、良好抗逆性的菌株。文章从畜禽养殖污水原液处理、模拟污水处理和微生物群落结构变化分析等方向对WD211菌污水处理效果进行了初步研究。研究结果表明，外源添加WD211菌对畜禽养殖污水的TN和NH4+-N的去除效率有明显提升，可达25.03%和27.30%，高于空白对照；外源添加WD211菌对畜禽养殖污水的NH4+-N的生化去除能力有促进作用，且这种促进作用在2%添加剂量时更为明显。模拟污水中WD211菌对COD、TN、NH4+-N的去除率分别为83.16%、28.35%、44.58%，仅积累少量的NO3--N（0.907 mg/L）和NO2--N（0.047 mg/L）。WD211菌在NH4+-N浓度较高的条件下能发挥较好的性能；外源添加WD211菌后，水样中假单胞菌属、类产碱菌属和副球菌属等脱氮相关菌属丰度上升。
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氯虫苯甲酰胺防治荔枝蒂蛀虫应用潜力分析
《中国农学通报 》 2024 CSCD
摘要：为系统评价氯虫苯甲酰胺防治荔枝蒂蛀虫的应用潜力，采用浸卵法和药膜法测定氯虫苯甲酰胺对蒂蛀虫卵和成虫的生物活性，研究其对蒂蛀虫成虫寿命和繁殖力的影响，并开展田间防效试验。室内结果表明，氯虫苯甲酰胺对蒂蛀虫2日龄卵的LC50为10.650 mg/L，杀卵活性显著高于高效氯氟氰菊酯，但低于除虫脲；对成虫24 h的LC50为145.856 mg/L，与高效氯氟氰菊酯相当。氯虫苯甲酰胺LC10和LC30剂量对荔枝蒂蛀虫雄蛾寿命和子一代卵孵化率影响较小，但可有效降低雌蛾寿命和产卵量。在蒂蛀虫处于成虫产卵盛期至卵孵化期时施药1次，药后14 d调查发现，200 g/L氯虫苯甲酰胺悬浮剂1500、3000倍液处理区防效达95.29%,4500倍液处理区的防效为84.71%，这3个处理区的防效均显著高于200 g/L除虫脲悬浮剂1000倍液和25 g/L高效氯氟氰菊酯乳油500倍液的防效。氯虫苯甲酰胺是一种对防治荔枝蒂蛀虫有较大应用价值的药剂。
关键词： 氯虫苯甲酰胺 荔枝蒂蛀虫 生物活性 亚致死效应 田间防效
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嘧菌酯与甲基硫菌灵在荔枝采后贮藏保鲜中的应用及膳食暴露评估
《食品工业科技 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文探究了常温条件下不同浓度的嘧菌酯和甲基硫菌灵对采后荔枝果实保鲜效果的影响，在贮藏期间通过对荔枝生理指标进行分析从而筛选出较优的杀菌剂配方，并对筛选后的杀菌剂配方进行验证以及膳食暴露评估，最终获得可以在常温贮藏条件下延长荔枝货架期的保鲜方法。结果发现，在25℃贮藏条件下，采用25%嘧菌酯1600倍稀释液（M1600）、25%嘧菌酯1600倍稀释液复配70%甲基硫菌灵700倍稀释液（M1600+J700）处理荔枝可以显著抑制果实的呼吸强度（P＜0.05），降低果皮的相对电导率（P＜0.05）和果实的腐烂率（P＜0.05），且在一定程度上抑制了果肉中可溶性固形物TSS和维生素C含量的降低，较好地维持了荔枝果实的感官品质和食用价值。经对比发现，两种杀菌剂对荔枝的保鲜效果相当，但单独使用M1600在抑制荔枝果皮褐变方面效果较优。通过对贮藏期间荔枝全果和果肉中杀菌剂残留量的检测以及膳食暴露评估发现，单独使用嘧菌酯处理荔枝后整果中嘧菌酯的风险熵RQ远小于1，可以同时达到满足提高荔枝贮藏品质、安全食用以及降低经济成本的目的。该研究为荔枝等非呼吸跃变型果实采后品质提升的研究提供了技术参考。
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骨碎补大棚栽培品与野生品的广靶代谢组学比较分析
《广东农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]骨碎补是一种多年生传统中药材,目前药材原料多来源于野生采集,鲜见有人工栽培的报道.因过度采集,骨碎补野生资源破坏严重,导致药材资源锐减,人工种植成为必然趋势.在探索骨碎补设施大棚栽培技术的基础上,利用代谢组学技术开展大棚栽培药材与野生药材的靶向代谢组学比较研究,探讨栽培品与野生品主要代谢产物的差异,为骨碎补人工栽培技术推广提供依据.[方法]以骨碎补基源植物槲蕨为研究对象,采用UPLC-MS/MS分析技术对比分析设施大棚栽培3年的槲蕨根茎与其野生根茎之间的差异代谢物,并开展差异代谢物富集通路分析.[结果]从两种药材检测到的749种代谢物中筛选到100种差异代谢物,且与野生品相比,大棚栽培品中有58种代谢物含量上调、42种含量下调.这些差异代谢物主要包括黄酮类化合物、有机酸、氨基酸及其衍生物、酚酸类、生物碱、游离脂肪酸等.在大棚栽培品中,黄酮醇、黄酮碳糖苷、糖及糖类代谢物含量全部上调;而在野生品中,氨基酸及衍生物、酚酸类、溶血磷脂酰胆碱和花青素类代谢物含量上调幅度较大.通路富集分析结果显示,100个差异代谢物共注释到47条代谢通路,其中显著富集的有维生素B6代谢、芪类化合物生物合成、二芳基庚烷生物合成、姜酚的生物合成、黄酮和黄酮醇生物合成、半胱氨酸代谢、蛋氨酸代谢、花青素生物合成、氨酰基tRNA生物合成等途径.[结论]大棚栽培的骨碎补,其黄酮醇、黄酮碳糖苷、糖及糖类代谢物化合物含量显著高于野生品,因总黄酮被公认为主要药效成分,因此大棚栽培的骨碎补比野生品具有主效成分优势,可为骨碎补规模化设施栽培或人工栽培提供科学依据.
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华南地区早晚兼用型水稻产量和氮素吸收在早、晚季的差异特征
《中国农学通报 》 2024 CSCD
摘要：为明确华南双季稻区早晚兼用型水稻产量和氮素吸收在早、晚季的差异特征,以6个早晚兼用型水稻品种为试验材料,按当地高产栽培条件在早、晚季种植,测定其产量、产量构成、干物质积累和氮素吸收等。结果表明,早晚兼用型水稻在早、晚季种植时产量分别为6.68～7.91 t/hm~2和5.72～6.11 t/hm~2;早季产量显著高于晚季,平均增幅为1.53 t/hm~2。相关分析表明,较高的早季产量与其有效穗数和粒重的提高有关。早、晚季干物质积累量和氮素吸收差异显著;相对于晚季,早季成熟期干物质积累量和氮素吸收平均提高25.0%和29.5%。另外,早、晚季产量与其干物质积累量和氮素吸收显著正相关。早晚兼用型水稻在早季种植时具有较高的产量、物质生产和氮素吸收能力。研究结果可为华南地区早晚兼用型水稻的丰产栽培提供理论依据。
关键词： 早晚兼用型水稻 ‘丝苗米’ 产量 干物质积累 氮素吸收
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桔小实蝇BdorOBP2对甲基丁香酚及其结构类似物的结合分析
《环境昆虫学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文研究了桔小实蝇Bactrocera dorsalis气味结合蛋白BdorOBP2对甲基丁香酚（ME）及其结构类似物的结合特性，以期为基于蛋白结构的新型引诱剂的分子设计提供靶标蛋白。本研究扩增获得气味结合蛋白BdorOBP2基因并进行序列分析。三维结构预测显示，BdorOBP2具有6个α螺旋，同时含有6个保守的半胱氨酸残基。荧光定量结果表明BdorOBP2在雌雄虫触角中的表达水平最高，同时在足、翅等组织中表现出性别差异表达特性，推测BdorOBP2具有识别性信息素和寄主挥发物的双重作用。在对BdorOBP2蛋白表达和纯化的基础上，采用荧光竞争结合试验分析了BdorOBP2与甲基丁香酚及其类似物的结合能力，结果显示BdorOBP2蛋白对丁香酚、异丁香酚、甲基丁香酚、异丁香酚甲醚等4种化合物的结合能力相当。BdorOBP2在感受寄主挥发物及性信息素过程中挥发重要作用，为基于靶标蛋白的新型行为调控剂的分子设计提供了重要参考。
关键词： 桔小实蝇 气味结合蛋白 荧光竞争结合试验 甲基丁香酚类似物
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放养密度对日本鳗鲡夏秋两季养殖水质及营养品质的影响
《水生生物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：研究以日本鳗鲡（Anguilla japonica）为研究对象,分夏秋两季,调查并讨论了放养密度对养殖鱼水质和营养品质变化的影响。夏季低密度组放养密度分别为1.51 （1号塘）、1.50 （2号塘）和1.49 kg/m~2 （3号塘）,高密度组分别为2.17 （4号塘）、2.14 （5号塘）和2.13 kg/m~2 （6号塘）。秋季低密度组放养密度分别为1.74 （Ⅰ号塘）、1.72（Ⅱ号塘）和1.75 kg/m~2 （Ⅲ号塘）,高密度组分别为2.36 （Ⅳ号塘）、2.34（Ⅴ号塘）和2.36 kg/m~2 （Ⅵ号塘）。两次分别从每个养殖塘采集5份水样,每个密度组养殖塘随机采集4尾日本鳗鲡。结果显示:两季高密度塘水体透明度和溶氧显著低于低密度塘（P＜0.05）,总氮、总磷、氨氮、亚硝酸盐、COD、叶绿素a指标显著高于低密度塘（P＜0.05）,硅藻门、绿藻门、蓝藻门密度均大于低密度塘一个数量级,且经统计分析,夏季高密度组的蓝藻门密度显著高于低密度组（P＜0.05）。此外,高密度塘水体菌群Shannon指数显著低于低密度塘, Simpson指数则相反（P＜0.05）。在门水平上,经统计分析,夏秋两季高密度组放线菌门均显著低于低密度组（P＜0.05）;而夏季高密度组变形菌门极显著高于低密度组（P＜0.01）;秋季拟杆菌门显著高于低密度组（P＜0.05）。在营养品质方面,日本鳗鲡肌肉的硬度、剪切力、咀嚼性、回复性参数及粗脂肪和粗蛋白含量均显著小于低密度塘（P＜0.05）;水分含量显著高于低密度塘（P＜0.05）。综上,高密度与低密度塘相比,水质指标、藻类组成、菌群多样性及鱼体质构、营养成分等指标中大部分参数呈现一致性负面影响,共同构成日本鳗鲡品质与养殖环境的敏感参数。此外,夏季日本鳗鲡放养密度为2.13—2.17 kg/m~2水质呈现富营养化及轻度污染状态。
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广东省水资源-能源-粮食网络特征分析
《北京师范大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：广东省人口和产业高度集聚,对水资源-能源-粮食(WEF)依赖程度高,资源供需矛盾日益凸显,合理配置WEF资源,实现资源可持续利用具有重要现实意义.本研究基于复杂网络方法,构建广东省2007、2012、2017年的WEF资源网络模型,通过探索网络拓扑性质,挖掘网络关键节点和关键路径,作为资源优化配置的重点关注对象.结果表明:1)广东省WEF资源网络具备小世界属性,能源网络的小世界属性较强,水资源网络较弱,关键节点和关键边的调控均会对WEF资源网络形成较大影响;2)农业(农林牧渔产品和服务),食品和烟草,化学产品,电力、热力的生产和供应,建筑,通信设备、计算机和其他电子设备制造等关键节点具备较大点强度,其资源调控对广东省水资源、能源、粮食的节约效应显著;3)电气机械和器材制造,建筑,通信设备、计算机和其他电子设备制造在WEF资源网络中处于枢纽位置,其资源节约效应可快速传递至整个网络;4)农业→食品和烟草、农业→纺织品、食品和烟草→住宿和餐饮等边频繁出现于WEF资源网络的关键路径之中,改变其资源流通量,可显著改变所在关键路径甚至整个WEF资源网络的流通量.
关键词： 水-能源-粮食 资源网络 关键节点 关键路径 广东省
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