科研产出
转基因抗除草剂大豆ZH10-6转化体特异性定量检测体系的建立
《上海农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:以新型转基因抗除草剂大豆ZH10-6外源插入片段的旁侧序列为靶标,建立了转化体特异性实时荧光PCR和单通道微滴式数字PCR精准定量检测体系,并邀请8家农业农村部检测中心对检测方法的准确性进行验证.结果表明:该转化体特异性实时荧光定量检测方法具有良好的特异性、重复性及广泛的适用性,定量极限达到50 copies∕μL,检测极限达到5 copies∕μL.该检测方法有望作为检测标准用于转基因抗除草剂大豆ZH10-6的定量检测,为该大豆品系的商业化应用及转基因标识等监管提供技术支撑.
关键词: 抗除草剂大豆ZH10-6 转化体特异性 定量检测 实时荧光PCR 微滴式数字PCR
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上海蚕豆地方资源鉴定评价与遗传多样性分析
《上海农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为了解上海蚕豆地方资源的遗传多样性,对"第三次全国农作物种质资源普查与收集行动"中收集的43份蚕豆种质的主要农艺性状进行鉴定评价.结果表明:这些蚕豆资源存在丰富的遗传多样性,13个数量性状的变异系数在5.7%-37.5%.相关分析显示,单株产量和单株荚数均与单株粒数呈极显著正相关(P<0.01).主成分分析结果表明,5个主成分累计贡献率达75.560%,主要与产量、籽粒和荚果性状相关.聚类分析将其分为两大类群,分别包含32份和11份蚕豆资源.第Ⅰ类群又分为2个亚群,亚群Ⅰ-1籽粒大、单株产量高、种皮浅褐色,亚群Ⅰ-2籽粒较大,可作为大粒新品种的育种材料;第Ⅱ类群籽粒较小、单株荚数较高,可作为小粒多荚新品种的育种材料.研究结果可为蚕豆品种改良提供材料基础.
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不同轮作模式对稻田土壤肥力和微生物群落结构的影响
《农业环境科学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为了探索不同水稻轮作模式对稻田土壤微生物群落结构的影响,以及与土壤养分供给的关系,本研究采用高通量测序技术对3种不同轮作模式下(水稻-小麦轮作、水稻-紫云英轮作、水稻-休耕)土壤细菌和真菌的群落结构变化进行分析,并进一步探讨了微生物群落结构与土壤养分含量之间的相互关系.结果表明:水稻-紫云英轮作模式能够明显改善稻田土壤的综合肥力,紫云英连续翻压还田后显著提高了土壤中总氮(TN)和有效氮(AN)的含量.土壤微生物群落结构方面,不同种植模式对细菌群落结构的影响大于真菌.水稻-紫云英轮作模式中优势菌群如酸杆菌门(Acidobacteriota)和子囊菌门(Ascomycota)等的富集有助于促进土壤生态系统的养分循环与生态健康.不同种植模式条件下土壤养分的变化如TN、AN、总钾(TK)及速效钾(AK)等可能是导致土壤细菌和真菌群落结构发生变化的主要驱动因素.稻田土壤中细菌群落结构对于土壤养分变化的敏感性要高于真菌.综合来看,水稻-紫云英轮作模式是更加适合水稻生态可持续栽培的种植模式,能够明显改善稻田土壤的综合肥力和土壤微生态环境.
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市售现磨咖啡和速溶咖啡的营养成分分析
《安徽农学通报 》 2024
摘要:本文采用相关国家标准检测方法,对45批次现磨咖啡样品和14批次速溶咖啡样品中多种营养物质的成分(包括可溶性固形物、元素、蛋白质、脂肪、碳水化合物、能量、氨基酸、脂肪酸和维生素A等)进行测定,并分析其主要营养成分差异.结果表明,咖啡中的主要营养物质为可溶性固形物,其可在一定程度上给人体补充碳水化合物、脂肪和蛋白质等营养物质,以及部分人体必需的元素.因咖啡配方不同,各类咖啡营养成分的含量存在较大差异.由于部分咖啡样品糖度较高,或钠含量较高,消费者需要根据自身的健康状况合理选择.
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不同光质照射对白玉菇子实体农艺性状及品质的影响
《上海蔬菜 》 2024
摘要:为探明不同光照条件对工厂栽培白玉菇农艺性状、产量和品质的影响,作者将搔菌后的白玉菇栽培瓶分别置于红光、蓝光、绿光、红蓝光、红绿光、绿蓝光、红绿蓝光、黑暗环境进行培养,以工厂生产的白玉菇为对照,测定不同光照条件下白玉菇的产量、农艺性状、质构品质等指标,通过主成分分析法综合评价不同光照条件下白玉菇子实体的品质.试验结果表明,蓝光、红绿蓝光处理白玉菇产量较高(分别为196.53 g和188.22 g),红光处理产量最低(168.08 g);红蓝光和红绿蓝光处理子实体的商品性状和口感较好.主成分分析结果表明,红绿蓝光、红蓝光和蓝光处理白玉菇子实体品质的综合得分较高,黑暗环境处理品质得分最低.研究结果可为优化工厂化栽培白玉菇光质条件提供参考,对进一步提高白玉菇的产量和品质具有一定的指导意义.
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稻鳝种养模式对土壤氨氧化微生物群落多样性和结构的影响
《农业环境科学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为深入了解稻鳝种养模式对土壤氮循环关键微生物的影响,本研究采用Illumina MiSeq高通量测序系统,分析了稻鳝种养模式下氨氧化微生物[氨氧化古菌(AOA)、氨氧化细菌(AOB)和完全氨氧化微生物(Comammox)]的群落结构和多样性,以明确该模式对土壤氨氧化微生物群落的影响机制。试验设置两个处理(常规稻田处理和稻鳝种养处理),分别在处理小区的中心区域和沟渠边缘区域取样,即:常规稻田中心区域(CCS)、常规稻田沟渠边缘区域(CMS)、稻鳝种养处理中心区域(ICS)和稻鳝种养处理沟渠边缘区域(IMS)。结果表明:与常规稻田处理相比,稻鳝种养模式显著降低了土壤pH,减少了稻田中心区域和边缘区域间有机质和总氮的含量差异,增加了土壤硝化势;相较于常规稻田处理,稻鳝种养模式显著提高了AOA、Comammox Clade-A和Comammox Clade-B的丰富度,显著降低了AOB的丰富度;同时,IMS显著提高了AOA的群落多样性,但降低了AOB的群落多样性;土壤pH、有机质和速效氮是影响氨氧化微生物的关键环境因子(P<0.05);AOA和Comammox促进了土壤硝化速率,而AOB反之;稻鳝种养模式改变了氨氧化微生物群落的结构,并增强了氨氧化微生物之间的信息交流,使其内部连接更加紧密。研究表明,稻鳝种养模式通过改变土壤环境因子,特别是土壤pH、有机质和速效氮,显著影响了土壤氨氧化微生物群落的组成、结构和多样性,增强了氨氧化微生物之间的相互作用,对土壤氮循环关键微生物产生了重要影响。
关键词: 稻鳝种养 氨氧化微生物 高通量测序 土壤理化性质 微生物群落
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上海地方猪种抗腹泻基因与免疫相关因子分析
《中国农业科技导报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为鉴定上海地方猪种上海白猪、枫泾猪和沙乌头猪中抗腹泻基因抗原加工相关转运体1(transporterassociated with antigen processing 1, TAP1)、α(1, 2)岩藻糖转移酶1[α (1, 2)-fucosyltransferase 1, FUT1]、天然抗性相关的巨噬细胞蛋白1(natural resistance-associated macrophage protein 1, NRAMP1)、黏蛋白4(mucin 4,MUC4)和黏蛋白13(mucin 13, MUC13)基因的有效遗传标记,为上海地方猪种资源特性提供参考,应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism, PCRRFLR)和序列测序分析上述基因的多态性,结合部分免疫相关因子,探讨对3个上海地方猪种免疫力的影响。结果显示,3个猪种中TAP1和MUC4基因均具有抗腹泻基因型GG,而仅在枫泾猪和沙乌头猪中检测到MUC13基因抗腹泻基因型GG,在3个猪种中均未检测到FUT1和NRAMP1基因抗腹泻基因型AA。上海白猪、枫泾猪和沙乌头猪TAP1基因处于中度多态,上海白猪的MUC4基因处于低度多态,枫泾猪和沙乌头猪的MUC4基因处于中度多态,上海白猪MUC13基因处于中度多态,其中上海白猪和沙乌头猪的TAP1基因不满足HardyWeinberg平衡,枫泾猪的MUC4基因不满足Hardy-Weinberg平衡。上海白猪MUC13基因AA型的白细胞介素12(interleukin-12, IL-12)水平显著高于AG型,枫泾猪TAP1基因AA型的肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor, TNF-α)指标显著高于GG和AG型,沙乌头猪TAP1基因AG型的IL-12指标显著高于GG型。以上研究结果对上海白猪、枫泾猪和沙乌头猪的抗腹泻育种和分子选育具有一定指导意义,为今后上海各地方猪种抗腹泻育种工作奠定了基础。
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利用F2:3群体对甜玉米籽粒性状的QTL定位
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:籽粒大小和重量是玉米产量的重要组成部分,同时籽粒大小也是影响外观品质的重要因素。本研究利用甜玉米自交系SHL03和SHL01为亲本构建的F2:3群体,对完熟期玉米籽粒性状的粒长、粒宽、籽粒直径和百粒重进行QTL定位。共定位到35个相关的QTL,位于玉米的10条染色体上,其中百粒重QTL 5个,籽粒大小QTL 30个,解释表型变异的2.44%~12.2%。主效QTL qKD10、qHKW7、qKW6的表型贡献率分别为11.44%、12.2%、10.15%。在3、6、9、10号染色体上同一区域内检测到了控制不同性状的基因组区段。从主效QTL的置信区间共找到27个注释基因,根据功能注释以及表达谱分析筛选出候选基因Zm00001d023994、Zm00001d035561、Zm00001d024027、Zm00001d020325、Zm00001d020374、Zm00001d020311、Zm00001d020409直接或者间接影响着玉米籽粒的发育。研究结果为甜玉米籽粒大小和百粒重性状的遗传研究和分子标记辅助育种提供了一定帮助。
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利用转录组挖掘羊肚菌干旱胁迫相关基因
《食用菌学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为挖掘羊肚菌(Morchella sextelata)干旱胁迫相关基因,设置对照组和干旱组,每组3畦,待对照组子实体生长至黑褐色时,每畦随机取1个子实体样品,通过转录组测序和基因功能注释分析对照组与干旱组的差异表达基因,采用GO和KEGG富集分析显著富集的GO条目和KEGG代谢通路,再根据GO和KEGG富集分析结果,通过基因注释信息确定与干旱胁迫相关的关键差异表达基因,随机选择5个与干旱胁迫相关的关键差异表达基因进行荧光定量PCR验证.结果表明:对照组子实体颜色白至淡黄、外观丰满,干旱组子实体颜色偏黑褐色、外观干瘪,且子实体较小;对照组与干旱组相比,共获得2 817个差异表达基因,其中上调表达基因1 492个,下调表达基因1 325个;GO富集结果表明,差异表达基因显著富集于DNA复制、DNA依赖性DNA复制、单糖运输、蛋白质-DNA复合物、核糖体、MCM复合体、核糖体的结构成分、FAD结合能力和溶质:阳离子同向转运蛋白活性等;KEGG富集结果表明,差异表达基因主要参与DNA复制、错配修复、类固醇生物合成、核糖体、剪辑切除修复、核苷酸切除修复、甲烷代谢、淀粉和蔗糖代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、硫铵代谢等过程;与干旱胁迫相关的18个关键差异表达基因包括转运蛋白、热激蛋白、转录因子、激酶和自噬相关基因;荧光定量PCR测定结果与转录组测序分析的关键差异表达基因结果一致.
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