科研产出
青海省34份蚕豆资源抗赤斑病性评价分析
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：蚕豆赤斑病是蚕豆生产上最重要的世界性病害之一,也是影响青海省蚕豆产量和品质最重要的病害。在多环境试验中,蚕豆资源抗赤斑病普遍存在基因型效应、环境效应及两者之间互作效应,科学评价资源的抗性与稳定性有助于全面了解资源特性。本研究自2015-2019年连续于4个地点采用大田自然发病的方法进行抗性鉴定,评价青海省34份蚕豆资源对蚕豆赤斑病的抗性,利用GGE双标图筛选出最佳基因型与测试环境。结果显示,‘VF4’、‘VF5’、‘VF6’3个资源对蚕豆赤斑病的抗性和抗病稳定性较其余31份资源都表现良好,可优先利用其对蚕豆赤斑病的抗性进行育种。以大有山和植保所试验地为代表的低海拔、中海拔生态区具有较好的区分力与代表性,以南门峡试验点为代表的高海拔生态区区分力较好,但代表性较差,可用来淘汰抗性较差且抗性不稳定的资源。
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长角血蜱蛋白质二硫键异构酶-2的生物信息学分析
《基因组学与应用生物学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在利用生物信息学软件分析长角血蜱的蛋白质二硫键异构酶（protein disulfide isomerase-2,PDI-2）的结构特点，并预测其B、T细胞抗原表位。利用ProtParam分析PDI-2蛋白质的理化性质,利用SignalP分析蛋白的信号肽，利用SOSUI分析蛋白可溶性，利用Bcepred分析蛋白表面可及性、柔韧性和亲（疏）水性,利用ProSacle分析蛋白亲水性区域，利用MotifScan分析蛋白翻译后修饰位点，利用SOPMA分析蛋白的二级结构,利用Phyre2预测蛋白质三级结构，利用IEDB、BepiPred、SYFPEITHI预测其T、B细胞抗原表位。结果显示，长角血蜱PDI-2的分子式为C2538H3966N654O795S17，理论等电点为4.85;PDI-2含有13个（scores≥1.9）高亲水性区域，11个（scores≥2.0）柔韧性区域，11个（scores≥1.9）表面可及性区域；该蛋白含有20个蛋白翻译后修饰位点；α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲分别占42.69%、19.44%、5.01%和32.87%；最终预测PDI-2蛋白存在20个CTL优势表位和3个Th优势表位，可能的B细胞抗原表位有23个。本研究发现PDI-2蛋白含有丰富的抗原表位，为深入研究该蛋白提供了理论依据。
关键词： 长角血蜱 PDI-2 蛋白特性 抗原表位 生物信息学分析
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禾谷类作物茎秆特性与茎倒伏关系的研究
《植物生理学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：倒伏是作物生产中重要限制因子之一,倒伏会使作物产量降低、品质变差。作物倒伏主要分为根倒伏和茎倒伏,禾谷类作物中茎倒伏研究报道居多。茎秆纵向生长调控株高,其与赤霉素、生长素等激素生物合成及其信号转导途经相关;横向生长同茎粗和壁厚等性状密切相关,主要涉及纤维素、木质素等结构性碳水化合物的合成和代谢过程。抑制茎秆纵向生长促进横向生长,可使株高降低,茎秆变粗,茎秆抗折力提升,最终增强植株抗倒伏特性。本文对禾谷类作物茎秆特性与倒伏关系研究以及抗倒伏性状调控机理进行阐述,以期为作物抗倒伏品种选育及其机理研究提供参考。
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中度嗜盐菌ST77及其萃取物对马铃薯干腐病的防效及菌株鉴定
《福建农林大学学报(自然科学版) 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：采用平板对峙法和牛津杯法测定菌株ST77及其3种有机溶剂（氯仿、乙酸乙酯、正丁醇）萃取物对马铃薯干腐病的抑菌活性;通过活体试验,测定菌株ST77发酵液及其3种有机溶剂萃取物对马铃薯干腐病的活体防效,并进行安全性评价;采用形态学观察、生理生化特征鉴定及分子生物学方法对菌株ST77进行鉴定.结果表明:中度嗜盐菌ST77及其萃取物对马铃薯干腐病病原真菌青9A-4-13、青9A-5-2和65B-2-6具有不同程度的抑制作用,抑菌圈直径最大为0.60 cm;中度嗜盐菌ST77发酵液及其萃取物能够完全抑制马铃薯活体上病原真菌65B-2-6的生长,坏果率为零,对其他病原真菌具有不同程度的抑制作用.其中,中度嗜盐菌ST77正丁醇萃取物对马铃薯干腐病病原真菌的抑制活性较高;同时,ST77发酵液及其正丁醇萃取物对马铃薯储藏安全.经鉴定,菌株ST77为短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus）.
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青海省小麦种质资源抗条锈鉴定和抗病基因筛选
《西南农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本实验对95份青海省种质资源进行苗期、成株期抗条锈病鉴定和分子检测,筛选出其中的抗病基因,为小麦抗条锈病育种及抗源的合理布局提供依据。【方法】选取95份青海省小麦品种,利用对当前条锈菌流行小种CYR32、CYR33、CYR34进行苗期、成株期抗病性鉴定,同时利用已有的分子标记（Yr5、Yr9、Yr10、Yrl5、Yr17、Yr18和Yr26）进行分子检测,并结合系谱分析推测可能的抗条锈病基因。【结果】苗期抗病性鉴定:CYR32免疫材料为10份（11%）,高抗性85份（89%）;CYR33免疫材料44份（46%）,高抗50份（53%）,中抗1份（1%）;小种CYR34免疫材料为3份（3%）,抗病11份（12%）,感病81份（85%）。在参试品种中有12份材料对CYR32、CYR33和CYR34同时表现抗病。成株期抗病性鉴定:2年抗性对比显示,12份小麦品种（13%）抗病性增强;8份（8%）材料仍保持抗性,但抗性在逐渐减弱;74份材料（78%）抗病性在减弱,从抗病逐渐演变为感病。分子检测结果表明,供试小麦品种中可能携带Yr系列基因的材料分别为Yr5（78%）、Yr9（17%）、Yr10（53%）、Yr15（76%）、Yr17（78%）、Yr18（73%）和Yr26（81%）。【结论】分子检测结果表明:Yr5、Yr15和Yr26基因在青海小麦种植中过于频繁使用,特别是Yr26被过度依赖,随着新毒性小种的发展尤其是CYR34出现,造成很多已有品种对条锈病降低或者丧失了抗病性。
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126份芜菁种质资源地上部表型的多样性分析
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：芜菁是十字花科芸薹属蔬菜作物,具有耐低温、耐贫瘠等优良特征,能够在海拔4 000 m的高原地区种植。为了明晰芜菁种质资源地上部表型的特征特性,本研究以126份芜菁种质资源为材料,分析了其地上部性状的多样性。结果显示芜菁叶片呈现出比较丰富的多样性,其中叶片长度分布范围为20.8～63.17 cm,叶宽分布在6.7～23.5 cm之间,叶片形状、裂片数量、叶片绒毛和叶柄形状均表现出丰富的表型性状。多样性分析显示叶柄宽的变异系数最大,达91.26%,多样性指数最高的性状是叶片绒毛;相关性分析表明叶长与株高的相关性最高;主成分分析结果显示8个主成分因子的贡献率达73.255%;聚类分析结果将126份芜菁种质分为3大类,其中第一类包括1份资源,第二类包括21份资源,第三类包括104份资源;采用隶属函数对126份芜菁种质进行了资源分析,最终筛选出15份具有明显优势的种质,其中7份材料适于作为食用芜菁种植,8份种质材料适于作为冬储牧草的饲用材料,为后续研究、加工利用提供可选优质材料。本研究结果将为芜菁种质资源的利用和鉴定提供有效信息。
关键词： 芜菁（Brassica rapa var. rapa） 种质资源 性状 多样性分析 隶属函数
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春小麦品系'MY002894'和'YJ006793'成株期抗条锈病基因遗传分析
《植物保护 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：春小麦品系‘MY002894’和‘YJ006793’对小麦条锈病具有成株期抗性。本研究分析了这2个品系成株期抗条锈病基因遗传规律,促进其有效利用。通过‘MY002894’与‘Taichung 29’（T29）抗-感杂交和‘MY002894’与‘YJ006793’抗-抗杂交构建F2∶3代分离群体,在青海省农林科学院植物保护研究所小麦条锈病自然病圃进行了两年的抗病表型鉴定。遗传分析结果显示,‘MY002894’与‘T29’ F2∶3杂交群体卡方测验符合7R∶9S的抗感分离比,表明‘MY002894’中含有2对独立作用的隐性成株期抗条锈病基因;‘MY002894’与‘YJ006793’F2∶3群体卡方测验符合55R∶9S的抗感分离比,表明‘MY002894’与‘YJ006793’杂交F2∶3杂交群体对条锈病的抗性由1对显性基因2对隐性基因独立控制。由于‘MY002894’中有2对独立作用的隐性成株期抗条锈病基因,推测‘YJ006793’中可能含有1对显性成株期抗条锈病基因。
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基于流式细胞仪鉴定菊芋倍性方法的建立及应用
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用流式细胞仪检测菊芋种质的染色体倍性,为菊芋的种质鉴定及遗传育种研究提供基础数据。【方法】建立基于流式细胞仪检测菊芋倍性的检测体系,并针对不同电压（（340,365.3和422 V））、聚乙烯吡咯烷酮（PVP）添加与否、取样部位（老叶、嫩叶、块茎和根）对体系进行优化。利用建立的稳定优化体系对302份菊芋种质资源的倍性进行检测。【结果】针对菊芋材料,选取幼嫩叶片,在样品处理时添加PVP溶液消除多酚及多糖物质的干扰,检测电压选用365.3 V,以流式细胞仪进行倍性检测的效果较好,准确性较高。302份菊芋种质资源倍性检测结果表明,整体变异系数在2.17～9.74,二倍体共3份,仅占资源总数的0.99%;四倍体共25份,占资源总数的8.28%;六倍体共274份,占资源总数的90.73%。【结论】基于流式细胞仪建立的菊芋种质资源倍性鉴定方法检测效果较好,准确性较高。
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种植密度对油菜正反交组合产量与倒伏相关性状的影响
《作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：高产抗倒不协调是油菜生产中最主要的矛盾,严重制约着油菜生产效益的进一步提高。在高密度、机械化生产模式下,这种矛盾尤为突出。受母系遗传的影响,杂交油菜的正、反交组合在产量与倒伏相关性状上常表现出明显差异,但种植密度对不同杂交组合这些关键性状的影响尚不明确。本研究针对浙油50、华航901及其正交（华航901×浙油50）与反交（浙油50×华航901）组合设置5个种植密度,考察其产量及倒伏相关性状并计算其杂种优势,研究种植密度对亲本及正、反交组合产量与倒伏相关性状的影响,为当前高密度直播生产模式下杂交油菜亲本的选配提供依据。结果表明,随种植密度增加,亲本及正、反交组合的实际产量和经济系数均呈先增后降的趋势,且无论正、反交组合,其实际产量的动态变化规律均与父本更为接近;倒伏指数在两点随种植密度的变化规律不同,但无论正、反交组合,其倒伏指数的动态变化规律均与母本相一致。在西宁试点,杂交组合产量均具有明显的平均杂种优势,且正交组合比反交组合具有更大的杂种优势;正交组合具有一定的抗倒性杂种优势,但是反交组合无抗倒性杂种优势。综上所述,高密度直播生产模式下,杂交油菜亲本选配推荐方案以高产品种为父本,抗倒性强的品种为母本进行组配,可以获得高产、抗倒性强且更适宜密植的杂交油菜品种。
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基于转录组的唐古特白刺密码子偏好性分析
《干旱区资源与环境 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：通过分析唐古特白刺转录组测序数据,从中筛选出28614条高质量序列为研究对象,利用CodonW、Excel等软件分析密码子偏好性使用规律。结果表明:唐古特白刺有效密码子数值分布在23.71-61之间,小于35的有94条,密码子的偏好性较弱,GC3S的平均含量为37.53%,说明唐古特白刺密码子第3位主要以A、T结尾。中性绘图、ENc-GC3S分析、偏倚分析结果表明,唐古特白刺转录组密码子偏好性主要受突变压力的影响;以ENc值和RSCU值为参考标准,最终确定28个高频密码子（RSCU>1）,其中以AU结尾的有25个,以G结尾的有3个,10个最优密码子中,9个以AU结尾,说明唐古特白刺转录组偏好以A/U结尾的密码子。经过对25种植物最优密码子的偏好性分析,真菌类以G/C结尾,双子叶植物多数以A/U结尾,密码子偏好性没有明显的规律性;15种植物的叶绿体基因组最优密码子的GC3S数值在27-29之间,均以A/U结尾,呈现明显选择限制。研究结果为深入了解白刺转录组编码序列的碱基含量、密码子偏向性等基因序列特征提供信息,为有效的利用野生唐古特白刺资源提供理论基础。
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