科研产出
1株HoBi样瘟病毒的分离与序列分析
《中国兽医学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：本研究在MDBK细胞培养物中发现并分离出1株HoBi样瘟病毒,将该毒株命名为JS12/01。应用RT-PCR方法分段扩增该毒株的全基因组序列,并对其基因组序列进行分析。结果显示,该毒株基因序列2端分别为5′端非编码区(5′untranslated region,5′-UTR)和3′端非编码区(3′untranslated region,3′-UTR),编码区为11 700nt。与GenBank中登录的部分瘟病毒属代表毒株5′-UTR区序列进行进化分析,结果表明,该毒株属于HoBi样瘟病毒巴西源亚型。本研究中的HoBi样瘟病毒JS12/01株为国内首次分离鉴定,证实了该病毒在中国的存在,需要对该病毒的扩散与流行采取预防措施。
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鸟巢蕨转录组高通量测序及分析
《园艺学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：采用新一代高通量测序技术Illumina Hi Seq 2000对鸟巢蕨转录组(Asplenium nidus)进行测序,共获得29 254 595个序列读取片段(reads),包含了5 908 586 517个碱基序列(bp)信息。对reads进行序列组装,共获得42 907个单基因簇(Unigene),平均长度936 bp,序列信息达到了40.16 Mb。数据库中的序列同源性比较表明,24 993个Unigene与其他物种的已知基因具有不同程度的同源性。鸟巢蕨转录组中的Unigene根据GO功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物学过程3大类51个分支,其中有大量的Unigene与代谢进程、结合活性、催化活性和细胞进程相关。将Unigene与COG数据库进行比对,根据其功能大致可分为24类。KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将Unigene定位到116个代谢途径分支。SSR位点查找发现,从42 907个Unigene中共找到6 067个SSR位点。SSR不同重复基序类型中,出现频率最高的为AG/CT,其次是AC/GT、A/T和AGG/CCT。针对这些序列,设计了20对引物进行了扩增效率和多态性检测,其中7对引物在不同蕨类材料中表现出多态性。
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沼液贮存及田间施用后大肠菌群的消长动态
《生态与农村环境学报 》 2014 北大核心 CSCD CSSCI
摘要：以猪场粪污水厌氧发酵产生的沼液为材料,分别在冬春季和夏秋季对其采用加盖和无盖2种方式贮存,定期检测沼液中大肠菌群数量;通过田间生菜种植试验,定期施用大肠菌群数量(以下均以CFU计)分别为104(WF)、105(LF)、106(MF)和107g-1(HF)的沼液,在沼液施用完毕后第3、10、17和24天检测土壤、生菜表面和生菜体内大肠菌群数量。结果表明:夏秋季大肠菌群存活时间较长,沼液无盖贮存可使大肠菌群数量减少。沼液贮存50 d后,除冬春季无盖贮存的沼液中大肠菌群数量达到GB 8978—2002《污水综合排放标准》中三级排放要求,可以排放以外,其他处理均未达到排放要求。沼液中大肠菌群数量越高,经农田施用后土壤中大肠菌群数量越多,生菜表面和体内大肠菌群数量也越高,但随时间延长大肠菌群数量变化略有不同。检测期内,WF处理农田土壤中大肠菌群数量显著低于其他处理;沼液施毕后第3天,WF处理生菜表面及体内大肠菌群数量均显著小于HF和MF处理;24 d时各处理生菜体内大肠菌群数量均检测不到,达到GB 4789.3—2010《食品安全国家标准食品微生物学检验大肠菌群计数》要求,生菜表面大肠菌群数量对数值小于3.51,但未达GB 4789.3—2010要求。
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钙肥对不同内源钙含量水稻品种光合作用的影响
《江苏农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：以2种不同内源钙含量的水稻品种(WT和PC)为材料,通过不同方式施入钙肥(叶面喷施和水培),以及用15%聚乙二醇(PEG-6000)模拟干旱胁迫研究钙对供试水稻光合作用的影响。结果表明,水培方式中,加入适宜浓度的钙可以增强WT和PC的净光合速率,处理后1 d,0.5 mmol/L的钙对水稻光合作用促进最明显,3 d后促进效应消失,而通过叶面喷施仅对WT的净光合速率有促进效果,对PC没有促进作用,表明通过水培方式施用钙肥更加有利于增强光合作用;在15%PEG-6000模拟干旱胁迫下,5.0 mmol/L的钙处理1 d增强了WT的净光合速率,5.0 mmol/L和10.0 mmol/L的钙处理促进了PC的净光合速率。可见,施用适宜浓度外源钙可以缓解干旱逆境对供试水稻光合作用的影响。
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肠出血性大肠杆菌O157∶H7toxB基因的分片段克隆和表达
《江苏农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：根据Gen Bank已有tox B基因全长序列,分别设计6对引物扩增tox B基因,克隆到质粒p GEX-4T-1,构建重组菌BL21(plys)(p GEX-4T-1-tox B),IPTG诱导表达重组蛋白质,用Western blot鉴定重组蛋白质免疫原性。tox B基因片段大小分别为1 531 bp、1 590 bp、1 609 bp、1 603 bp、1 525 bp和1 690 bp,重组蛋白质分子量分别为8.1×104、8.3×104、8.4×104、8.3×104、8.0×104和8.7×104。以兔源EHEC O157∶H7抗血清为一抗,Western blot分析结果显示6个重组蛋白质均具有良好的免疫原性。
关键词： 肠出血性大肠杆菌O157∶H7 tox B基因 表达 免疫原性
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不同砧木与嫁接方式对甘薯开花结实的影响
《浙江农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：甘薯属短日照植物,在中国北方由于光照时间长,绝大多数品种不能自然开花。为克服这一障碍,甘薯育种工作者们通常采用嫁接和短日照处理相结合的方法促进甘薯开花结实。本研究用3种嫁接砧木、2种嫁接方式和2种日照处理方法,研究不同砧木和嫁接方式与甘薯接穗的亲和性及其对甘薯开花结实性的影响。结果表明,以甘薯二倍体野生种Ipomoea crassicaulis作为嫁接砧木的应用效果最好,不但具有广泛的亲和性,而且可以显著促进甘薯接穗的开花结实,从而节省育种成本,提高育种效率。
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基于全基因组重测序信息开发玉米H99自交系特异分子标记
《作物学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：随着基因组测序技术和计算生物学的发展,利用生物信息学的方法大规模挖掘基因组特异分子标记已成为可能。玉米自交系H99具有较强的可再生能力,是玉米转基因研究的主要供体材料,但是目前对H99基因组信息了解甚少。本研究利用高通量Illumina测序技术,对H99全基因组进行重测序,利用生物信息学手段大规模挖掘并开发了4043个H99特异性的SSR分子标记。随后利用模拟PCR策略,对开发的SSR分子标记进行电子多态性筛选,针对B73×H99、Mo17×H99和B73×Mo17三个群体亲本组合共开发2699候选的特异多态性SSR分子标记。随机挑选20对SSR分子标记对群体亲本B73、H99和Mo17进行多态性筛选,进一步证实候选的多态性具有95%的准确率。此外,基于B73参考序列对开发的多态性SSR分子标记进行全基因组染色体定位及基因注释,揭示了候选多态性SSR分子标记在全基因组及基因内的分布特征。为玉米自交系H99开发了大量的分子标记资源,同时也为快速开发品种间多态性分子标记提供了一套高效可行的分析方法。
关键词： 玉米H99自交系 高通量测序 电子PCR 多态性SSR
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H7-HCP-Tir-Intimin高效降低小鼠粪便中大肠杆菌O157:H7排菌
《中国兽医学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：构建BL21(PcoldⅠ-fliC-hcpA-tir-eae),并评价对小鼠的免疫原性,以期研制更加有效的候选免疫原,最大限度降低E.coli O157:H7对食物、环境和人类的危害。将946、423、309、811bp的fliC,hcpA,tir和eae基因被依次克隆,中间添加8个氨基酸的间隔序列,构建重组菌BL21(PcoldⅠ-fliC-hcpA-tir-eae)。进口白油和ISA50V作为佐剂与重组蛋白乳化,制备2种油乳剂疫苗,分别接种4周龄BALB/c雄鼠,二免21d,口服攻击E.coli O157:H7109 CFU/只,每天采集粪便,检测排菌。结果显示,2种重组疫苗均能够诱导高滴度血清IgG。ISA50V佐剂组抗体产生早于进口白油佐剂组,但进口白油佐剂组抗体滴度一致性更好。所有免疫组小鼠排菌极度降低,第1天排菌低于104 CFU/g,第5天检测不到排菌,整个检测期无反弹,而对照组在整个检测期排菌持续很高(>104 CFU/g)。结果表明,四价重组蛋白H7-HCP-Tir-Intimin能够高效降低口服大肠杆菌O157:H7后的排菌,极显著降低细菌的定植,很大程度减少病原传播,对环境和人类的威胁。
关键词： E.coli O157:H7 鞭毛 Ⅳ菌毛 紧密素转位受体蛋白 紧密素 疫苗 排菌 小鼠
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