克氏原螯虾细胞色素c基因通过调节凋亡途径抑制WSSV感染

公洁; 祝孟茹; 占铭; 席昌俊; 神国卿; 水燕; 徐增洪; 沈怀舜; 《渔业科学进展 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：细胞凋亡是由一系列相关基因严格调控的细胞程序性死亡，在抵御病原入侵、维持机体内环境稳态等方面有着重要意义。其中细胞色素c从线粒体释放到细胞质中是凋亡开始的关键一步。本研究利用RACE技术首次克隆获得了克氏原螯虾（Procambarus clarkii）细胞色素c基因（PcCytc），全长为897 bp，包括163 bp的5′-UTR、419 bp的3′-UTR和315 bp的开放阅读框，编码104个氨基酸。定量PCR检测结果显示，PcCytc基因在克氏原螯虾的各组织中均有表达，其中在鳃、肠道和肌肉中表达高，在胃中表达最低。WSSV感染实验显示，在病毒感染后PcCytc在肝胰腺、肠道和肌肉组织中的表达水平均出现上调，并在24 h达最高值，约是此时PBS组表达量的2.65、2.07和2.20倍，均存在极显著性差异（P＜0.01）。PcCytc基因干扰后，克氏原螯虾体内WSSV病毒拷贝数显著增加（P＜0.05），表明PcCytc能够抑制WSSV在克氏原螯虾体内的复制，延迟感染；同时，凋亡相关基因bcl-2、bax和caspase-3的表达均发生显著上调或下调（P＜0.05）。本研究表明，PcCytc可通过调节凋亡途径抑制WSSV感染，为克氏原螯虾对WSSV感染的免疫反应提供了新的见解。

关键词： 克氏原螯虾 细胞色素c 凋亡 WSSV感染 RNA干扰

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湖南湘江重现溯河洄游型刀鲚

姜涛; 李鸿; 杨健; 陈修报; 薛竣仁; 刘洪波; 《中国水产科学 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：随着十年禁捕政策的实施,长江刀鲚资源恢复效果已日益凸显,一些传统栖息地被发现重新有了刀鲚的分布.湖南湘江水域曾是洞庭湖水系内刀鲚的主要分布水域之一,但洄游型刀鲚长期被认为在该水域已绝迹.近期笔者对 2023 年 6 月 13 日采集自湖南湘江湘阴段的 1 尾刀鲚标本进行耳石微化学特征研究,以验证其所属的生态类型.结果发现,该个体耳石锶钙比生境特征可分为 5 个阶段,其中既有对应于淡水生境的 SⅠ(1.37±0.60)、SⅢ(2.80±0.16)和SⅤ(2.47±0.62)阶段,也有对应于河口半咸水的SⅡ(5.50±1.10)、SⅣ(4.52±0.94)阶段.此外SⅡ阶段有部分锶钙比高于 7,说明该个体还进入过海水栖息.锶含量面分布分析结果显示,自核心至边缘亦依次呈现蓝色、黄绿色、蓝色、黄绿色以及蓝色的不同盐度生境变化的"分色图谱"特征.上述结果确证了所研究个体为典型的溯河洄游型刀鲚.这也首次客观证实了十年禁捕政策实施后,洄游型刀鲚不仅能够重新自海区经长江进洞庭湖,而且更能自湖上溯至湘江水域.为保护洞庭湖内及各支流洄游型刀鲚资源,同时也为持久守护长江十年禁捕的成效,亟需开展洞庭湖及各支流内洄游性刀鲚的分布和关键生境的调查以及其资源保护.

关键词： 刀鲚 耳石 微化学 电子探针 湘江 洞庭湖

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两种麻醉剂对凡纳滨对虾麻醉效果及组织氧化损伤的影响

韦政坤; 董宏标; 赵文; 陈飞; 张传镶; 陈健; 宫保华; 朱长波; 张家松; 《南方水产科学 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：为明确丁香酚和MS-222对凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）的麻醉效果及相同效果下造成的二次应激，为两种麻醉剂在凡纳滨对虾中的应用提供参考数据与实验依据。研究了不同质量浓度丁香酚(20、30、40、60、80、100、120、140和160 mg·L^-1)和MS-222 (800、900、1 000、1 100、1 200、1 300、1 400、1 500和1 600 mg·L^-1)对体质量为（14±3） g凡纳滨对虾的麻醉效果，以及相同效果下对其机体生理和组织形态的影响。结果表明：1)丁香酚和MS-222的质量浓度分别为80和1 400 mg·L^-1时，对虾在3 min内进入深度麻醉阶段，5 min内恢复正常；2)使用这两种麻醉剂均会造成对虾的鳃和肝胰腺组织损伤，其中丁香酚组的鳃组织各项抗氧化指标早于MS-222组达到峰值；丁香酚组Caspase-3活性在麻醉复苏后6 h显著降低，而MS-222组则显著升高（P＜0.05）；丁香酚组和MS-222组的Na⁺/K⁺-ATP酶活性显著降低（P＜0.05）；组织形态分析显示两种麻醉剂均会引起对虾鳃和肝胰腺产生不同程度的变形或裂解损伤，而在麻醉复苏后6 h丁香酚组恢复正常。综上，丁香酚和MS-222对凡纳滨对虾均有麻醉效果，但MS-222所需浓度更高，且对机体造成的二次应激损伤更为严重。

关键词： 凡纳滨对虾 丁香酚 MS-222 麻醉效果 应激损伤

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"第二届国际渔业科技与创新大会"在广州召开

中国水产科学研究院; 《科学养鱼 》 2023 北大核心

摘要：日前，以“水产种业振兴引领渔业绿色发展”为主题的“第二届国际渔业科技与创新大会”在广州召开。来自中国水产科学研究院院属单位、中国科学院系统单位、渔业领域高等院校、地方科研院所、亚太水产养殖中心网(NACA)、中东欧水产养殖中心网(NACEE)等国内外科研机构、涉渔组织代表以及多国资深专家学者、科研人员参加会议。中国水产科学研究院院长王小虎出席大会并致辞，会议由中国水产科学研究院副院长韩刚主持。

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不同养殖阶段的大口黑鲈肠道结构和肠道微生物组成变化的比较

李鸣霄; 强俊; 徐钢春; 周国勤; 张茂友; 陶易凡; 路思琪; 李岩; 陆健; 徐跑; 《动物营养学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：为了探究不同养殖阶段的大口黑鲈（Micropterus salmoides）肠道组织学结构和肠道微生物组成的变化，本研究挑选孵化后第5、25、45和180天的大口黑鲈，分别代表开口摄食、转食人工配合饲料、适应人工配合饲料和成鱼养殖4个阶段，采集肠道组织，制作组织切片和测定消化酶活性，并提取DNA进行16S rDNA高通量测序分析。结果显示：大口黑鲈在第5、25、45和180天的肠道结构形态随着养殖周期延长而不断完善，其中肠道绒毛高度和杯状细胞数量不断增多。第45天幼鱼肠道淀粉酶活性显著高于第5天仔鱼（P＜0.05），但脂肪酶和蛋白酶活性无显著变化（P＞0.05）；第25天稚鱼3种消化酶活性最低，而第180天成鱼消化酶活性最高。此外，通过16S rDNA测序，从4组大口黑鲈肠道中共鉴定出了19个门和336个属，其中变形菌门是大口黑鲈的核心菌门，占所有肠道微生物的90.61%。气单胞菌属在第5天大口黑鲈肠道中占据优势地位，而第25天稚鱼肠道微生物群多样性具有显著优势，其中假单胞菌属、乳球菌属和不动杆菌属相对丰度增加；第45天幼鱼肠道中假单胞菌属和芽孢杆菌属相对丰度较高，第180天成鱼肠道中检测出以邻单胞菌属为代表的新优势菌群。综上所述，转食投喂人工配合饲料会改变大口黑鲈肠道消化酶活性，并驱动肠道优势微生物由气单胞菌属向假单胞菌属、乳球菌属等转变。

关键词： 大口黑鲈 苗种培育 食性转变 肠道结构 肠道微生物

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养殖工船鱼舱流速特性的实船试验研究

秦康; 崔铭超; 刘晃; 张成林; 《大连海洋大学学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：为掌握横摇运动对船载鱼舱流速特性的影响，采用实船试验，对养殖工船横摇运动下鱼舱流速特性进行研究，并分析其适渔性。结果表明：小幅横摇工况（横摇角度幅值在1°以内）下可仅考虑进水射流，忽略横摇运动对舱内水平流速的影响，但大幅横摇工况（横摇角度幅值在5°以上）下，相对于进水射流，横摇运动对舱内水平流速的影响更明显；横摇周期一定时，随着横摇角度幅值的增大，舱内水平流速增大，最大水平流速的位置向舱中部偏移，小幅横摇工况（横摇角度幅值在1°以内）下，舱中央区域的垂向流速方向整体呈向上趋势，近舱壁区域的垂向流速方向整体呈向下；横摇周期一定时，随着横摇角度幅值的增大，舱中央处向上的垂向流速区域缩小，向上的最大垂向流速降低，这一变化会促进舱中央区域内生物固体的沉降，更有利于集排污。研究表明，对于锚泊状态下的养殖工船，当横摇角度幅值在5°以内时鱼舱流速适合1龄以上大黄鱼（Larimichthys crocea）的养殖。

关键词： 水产养殖 养殖工船 横摇 流速 适渔性

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基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析

刘杨; 栾生; 刘绵宇; 李旭鹏; 孟宪红; 罗坤; 隋娟; 谭建; 代平; 曹家旺; 陈宝龙; 孔杰; 《水产学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响,本实验对26个全同胞家系进行VpAHPND侵染,收集686尾个体的存活时间数据,对其中242尾个体利用液相芯片"黄海芯1号"(55.0 K SNP)进行基因分型,基于A、G和H亲缘关系矩阵估计VpAHPND侵染后存活时间的遗传参数;采用随机和等距抽取方式,基于55.0 K SNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K),利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测VpAHPND侵染后存活时间的基因组育种值,利用交叉验证方法计算其预测准确性,并与BLUP方法进行对比分析.遗传参数估计结果显示,VpAHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平,估计值为0.68~0.79.在55.0 K SNP密度下,针对242尾基因分型个体数据集(G242),利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%;针对686尾表型测定个体数据集(P686),利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535,后者比前者提升了4.90%.对于8个低密度SNP面板,当SNP密度≥10.0 K时,基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小(1.1%~1.8%);随着SNP密度自10.0 K不断降低,基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低,其中5.0 K密度降幅为0.6%~2.6%、1.0 K密度降幅为5.8%~11.0%、0.5 K密度降幅为11.4%~17.2%、0.1 K密度降幅为38.8%~41.6%.10.0 K与55.0 K SNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99,表明利用10.0 K SNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV.研究表明,使用10.0 K SNP面板对VpAHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0 K SNP芯片近似的预测准确性,为低密度SNP分型芯片设计提供了参考.

关键词： 凡纳滨对虾 AHPND 低密度SNP面板 基因组预测准确性

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黄带拟鲹qRT-PCR内参基因筛选及验证

李杰锋; 王焕; 李步苏; 曾祥辉; 柳淑芳; 庄志猛; 《渔业科学进展 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：实时荧光定量PCR （qRT-PCR）是研究基因表达的一种广泛使用且有效的方法，选用黄带拟鲹（Pseudocaranx dentex）合适的内参基因，是qRT-PCR技术获得该物种基因表达可靠结果的关键。本研究首先测定了9个常用内参基因（β-actin、RPL13、EF-1α、GAPDH、HPRT、PPIA、β2M、TUB和PP2A）在黄带拟鲹成鱼组织中的表达丰度；同时，利用BestKeeper、NormFinder、geNorm和RefFinder 4种模型预测了内参基因的表达稳定性，发现其表达稳定性排序为RPL13＞EF-1α＞ PP2A＞HPRT＞PPIA＞TUB＞β2M＞β-actin＞GAPDH。进一步通过定量检测目标基因myod1在不同组织的表达情况，验证上述预测结果的准确性。研究发现，RPL13和EF-1α单独或联合作为黄带拟鲹qRT-PCR内参基因，可显著提高目标基因表达量检测结果的稳定性与可靠性。结果表明，RPL13和EF-1α可作为黄带拟鲹不同组织q RT-PCR分析的内参基因。同时，也证实了并不是管家基因的表达在所有物种中都具有良好的稳定性，需要根据实际情况筛选适宜的内参基因。本研究结果可为后续黄带拟鲹功能基因表达特征的研究提供技术支撑，有望适用于其他鲹科鱼类。

关键词： 黄带拟鲹 qRT-PCR 内参基因 稳定性

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基于罗氏沼虾染色体核型、同工酶及遗传多样性分析

张林; 甘金华; 张涛; 何力; 周剑光; 《华北农学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：为保护、评估及合理利用罗氏沼虾种质资源,为今后指导育种及养殖提供理论依据,以采自广西及江苏数丰良种场的罗氏沼虾为材料,采用PHA和秋水仙素肌肉注射、精巢或卵巢细胞直接制片法,对罗氏沼虾染色体核型进行了研究.采用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳技术,分析了罗氏沼虾肌肉或鳃组织乳酸脱氢酶(LDH)、苹果酸脱氢酶(MDH)、酯酶(EST)、醇脱氢酶(ADH)4种同工酶的组织表达模式,并初步分析了其生化遗传学特性及遗传结构.结果表明:罗氏沼虾为二倍体,2N=118=56M+24SM+10ST+28T,臂数(NF)为198.未发现带有随体或次缢痕的染色体及性染色体.4 种酶共记录出22个等位基因 15个基因位点,位点平均有效等位基因数(Ne)为1.47;4 种酶有7 个基因频率为 0.1500~0.8500的多态位点;多态位点比例P为46.7%;平均期望杂合度(He)值为0.191 7,平均观测杂合度(Ho)值为0.261 1,Hardy-Wein-berg遗传偏离指数(D)值为0.379 7,表明其杂合子过剩及缺失现象并存,但杂合子过剩现象更突出,说明该群体遗传变异范围较宽,变异程度较大,群体遗传多样性高,可为今后的人工育种提供良好的亲本.

关键词： 罗氏沼虾 染色体 核型 同工酶 遗传结构

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基于PC-RELM的养殖水体溶解氧数据流预测模型

施珮; 匡亮; 王泉; 袁永明; 《农业工程学报 》 2023 EI 北大核心 CSCD

摘要：养殖水体中溶解氧浓度一直是最重要的水质参数之一。为了精准地对水体溶解氧进行调控，提高养殖生产效率，降低养殖风险，该研究考虑外部天气条件对溶解氧的影响以及溶解氧自身的昼夜变化特征，提出一种基于正则化极限学习机（principal component analysis and clustering method optimized regularized extreme learning machine,PC-RELM）的养殖水体溶解氧数据流预测模型。首先，采用主成分分析法判断影响溶解氧浓度的强重要性因子，降低预测模型的数据维度；其次，利用熵权法计算各时刻点的天气环境指数，并利用快速动态时间规整算法（fast dynamic time warping,FastDTW）完成时间序列数据流在不同天气环境下的相似度度量；然后使用k-means算法对时间序列的相似度进行聚类分簇，并基于分簇结果完成正则化极限学习机预测模型的构建，实现溶解氧浓度的估算。最后将PC-RELM模型应用到无锡南泉试验基地养殖池塘的溶解氧预测调控过程中。试验结果表明：PC-RELM的预测均方根误差值（root mean square error,RMSE）为0.961 9，与PLS-ELM（partial least squares optimized ELM）、最小二乘支持向量机（least square support vector machine,LSSVM）以及BP神经网络模型进行对比，其RMSE值分别降低了41.54%、54.58%和67.16%。该预测模型可以有效地捕捉不同天气条件下溶解氧的变化特点，具有较高的预测精度和效率。

关键词： 溶解氧 养殖 水质 聚类 快速动态时间规整算法 正则化极限学习机

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