科研产出
生防菌株贝莱斯芽孢杆菌HNU24全基因组测序及分析
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:本研究旨在解析对茄雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)具有较强拮抗活性的生防菌株HNU24的基因组特征.采用BGISEQ-500和ONT PromethION平台相结合的策略,对HNU24的全基因组进行了测序、组装、基因预测与功能注释、蛋白质同源分析.遗传进化分析结果表明:HNU24为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),其完整基因组序列长度为3932768 bp,GC含量46.48%,编码3822个基因,其中有43个碳水化合物活性酶基因家族.纤维素酶活性实验进一步表明其具有分解纤维素的能力.在HNU24基因组中预测到13个次级代谢产物生物合成基因簇,其中包含表面活性素(surfactin)、泛革素(fengycin)、植物唑霉素(plantazolicin)、大环内酰亚胺(macrolactin)、杆菌烯(bacillaene)、地非西丁(difficidin)、杆菌毒素(bacillibactin)和杆溶菌素(bacilysin)8种已报道的对青枯菌等病原菌有拮抗活性的化合物.5个未能比对到同源基因或相似度较低,可能为未鉴定和报道的新化合物.此外,盆栽试验表明HNU24对番茄具有显著的促生长作用.综上,HNU24可能通过分泌活性化合物来拮抗茄雷尔氏菌并促进番茄生长,是一种潜在的生物肥料菌株,相关结果为进一步开展HNU24在生物防治方面的研究和应用奠定基础.
关键词: 贝莱斯芽孢杆菌 番茄青枯病 全基因组 次级代谢产物
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海南省奶源和养殖环境主要肠杆菌科细菌的分布及基因分型
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:本研究从2021年海南省两个奶牛场采集的52份样本中分离肠杆菌科细菌,并对分离菌株进行了毒力基因、质粒型和生物被膜形成能力检测及肠杆菌科细菌基因间重复序列分子分型(ERIC-PCR)研究,以期明确牛奶及奶牛场环境中肠杆菌科细菌分布流行状况及其生物学特性。首先,采用16S rDNA PCR和ERIC-PCR对分离的肠杆菌科细菌进行鉴定和去重,结果显示52份样本中分离到肠杆菌科细菌49株,其中大肠埃希菌(Escherichia coli)32株,肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)13株,阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)3株,产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)1株;其次,采用PCR方法进行了分离菌株的毒力基因检测,结果显示,ompA的检出率最高;之后,采用CARATTOLI创建的基于PCR的质粒复制子分型,结果显示K质粒的检出率最高;采用刚果红琼脂法对分离菌株进行了生物被膜形成能力定性检测,发现49株肠杆菌科细菌中有37株指示有生物被膜形成能力;最后,通过ERIC-PCR分型进行了肠杆菌科细菌的亲缘关系和遗传多样性分析,发现49株肠杆菌科菌株可划分为17型(Ⅰ~ⅩⅦ),Ⅵ型为优势型(均为Escherichia coli),共20株。整体研究表明肠杆菌科细菌在奶源环境中广泛存在、生物特性多样,推测具有一定的致病力和耐药性,引起人类和动物疾病风险较高,提示养殖、运输中的卫生和规范操作至关重要。
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玉米和玉米淀粉对断奶仔猪肠道屏障的影响
《中国兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:旨在探究玉米和玉米淀粉对断奶仔猪肠道屏障的影响及其分子机制。将72只28日龄断奶大白猪随机分为2组,每组2个重复(公、母各半),每个重复18只,分4栏饲养。分别饲喂玉米饲料和玉米淀粉饲料,预饲7 d,正式试验21 d。试验结束时检测断奶仔猪的生长性能、血清生化指标、消化道pH值、肠道绒毛形态、相关基因和信号通路的表达。结果显示,淀粉组仔猪平均日增质量和体质量显著低于玉米组(P<0.05),平均日采食量减少。血液生化检测结果显示,与玉米组相比,淀粉组血清谷草转氨酶(AST)、乳酸脱氢酶(LDH)的活性及总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、甘油三酯(TG)含量显著降低(P<0.05),γ-谷氨酰转肽酶(γ-GT)的活性、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和总胆固醇(TC)含量极显著降低(P<0.01),表明机体代谢受到抑制。淀粉组十二指肠pH值极显著上升(P<0.01),且HE切片显示十二指肠绒毛密度和细胞数明显减少。QRT-PCR检测肠道黏膜相关基因结果显示,与玉米组相比,淀粉组尾型同源盒基因(CDX2)和肿瘤坏死因子(TNFα) mRNA表达量显著下调(P<0.05),增殖细胞核抗原(PCNA)、闭锁蛋白(OCLN)和闭合蛋白(CLDN1) mRNA表达量极显著下调(P<0.01),表明肠道屏障发育受到抑制。Wnt信号通路活性检测显示,淀粉组Wnt家族成员10b(Wnt10b)、β-连环蛋白(β-catenin)和细胞周期大蛋白(CyclinD1)mRNA表达量极显著下调(P<0.01),与蛋白检测结果相符,表明仔猪肠道黏膜Wnt/β-catenin信号通路活性受到抑制。综上所述,相对于玉米饲料,玉米淀粉饲料会抑制Wnt/β-catenin信号通路抑制肠道屏障的发育影响肠道健康,进而影响仔猪的生长性能。比较2组饲料的营养成分,其中淀粉组中性洗涤纤维(NDF)含量低于玉米组,其可能是抑制Wnt/β-catenin信号通路影响肠屏障发育的主要因素之一。
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红麻种质资源对根结线虫抗性鉴定与评价
《植物遗传资源学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:为鉴定我国红麻种质资源对根结线虫病的抗病性,本研究采用SCAR引物对侵染红麻的根结线虫种群进行了鉴定,并采用田间自然发病及盆栽接种鉴定的的方法,对220份红麻野生或栽培种质资源的根结线虫抗性进行了鉴定与评价。研究结果表明,侵染红麻的线虫种类为南方根结线虫(Meloidogyne incognita)。田间抗性鉴定结果显示高抗红麻资源有133份,占资源总数量的60.45%,玫瑰茄、红叶木槿和金钱吊芙蓉全部表现为高抗,高抗比率最高。盆栽接种鉴定结果显示免疫资源有7份,占资源总数的3.18%;高抗资源有98份,占资源总数的44.55%;玫瑰茄均鉴定为高抗等级。红麻种质在田间自然发病和盆栽发病抗性鉴定存在一定的差异,两种方法鉴定结果一致的种质资源共有98份,其中高抗资源69份,占交集资源数量的70.41%;高抗资源中有49份来源于栽培红麻,10份来源于野生近缘,其余来源于玫瑰茄、玫瑰麻和红叶木槿,1份高感品种来自于野生近缘。本研究结果为红麻种质资源发掘利用提供科学依据。
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木瓜汁腌制对文昌鸡风味形成的影响
《食品科学 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要:为探究木瓜汁腌制对文昌鸡炖煮过程风味形成的影响,检测文昌鸡鸡胸、鸡腿原料肉的理化指标,并比较分析木瓜汁腌制前后,鸡胸和鸡腿炖煮后挥发性风味物质和滋味物质变化。结果表明:鸡胸原料肉中蛋白含量、还原糖含量显著高于鸡腿原料肉(P<0.05),脂肪含量显著低于鸡腿肉(P<0.05),二者硫胺素含量差异不显著(P>0.05);经过木瓜汁腌制的鸡腿中醛类、醇类物质种类及含量明显提高,新产生了(E)-2-庚烯醛、(E)-2-辛烯醛、(E)-2-壬烯醛、(Z)-2-癸烯醛、2-丁基-2-辛烯醛、4-乙基苯甲醛、2,5-二甲基苯甲醛、(E)-2-十一烯醛、(E,Z)-2,4-癸二烯醛9种醛类物质,而木瓜腌制鸡胸肉中挥发性物质种类无明显变化,主要体现含量的变化,电子鼻可区分木瓜汁腌制前后鸡腿肉的差异,但无法区分腌制前后鸡胸肉差异;木瓜腌制后可显著提升鸡胸和鸡腿肉中的游离氨基酸、风味核苷酸的含量。木瓜汁腌制可提高文昌鸡鸡胸和鸡腿肉中核苷酸与游离氨基酸含量,可提升鸡腿肉中挥发性风味物质含量,同时赋予了鸡腿肉醛类、醇类等新的风味物质。
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海南岛火焰兰SSR标记开发、遗传多样性与群体结构分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:为了开发火焰兰(Renanthera coccinea)的SSR引物,进而开展海南岛火焰兰的种质鉴定、遗传多样性和群体结构分析。本研究采用三代测序技术首先获得火焰兰参考转录组,然后开发了火焰兰的SSR引物,最后基于SSR引物利用分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析等方法对来自海南岛不同地理分布的396份火焰兰资源进行研究。结果表明,所开发的17对三核苷酸多态性SSR引物能够有效地鉴别所收集的396份火焰兰种质。AMOVA分析显示,火焰兰群体间呈现极高程度的遗传分化,并且群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异。群体结构分析显示,来自不同地理分布的海南岛火焰兰存在3个不同的基因库,而且绝大多数群体是独立进化的,只有少数群体存在遗传混合,这一结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。综上可知,本研究新开发的17对SSR引物有效鉴定了396份海南岛火焰兰种质,揭示了其遗传多样性和群体遗传结构,对火焰兰的种质资源保护和育种计划具有非常重要的参考价值。
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不同因子对台湾甲腹茧蜂交配的影响
《中国生物防治学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:台湾甲腹茧蜂Chelonus formosanus Sonan是多种鳞翅目害虫的重要寄生性天敌,对害虫的生物防治具有较大利用价值.为探明不同因子对台湾甲腹茧蜂交配率的影响,以提高其雌蜂的比例,从而提升室内扩繁效果,本试验研究了不同温度、营养、雌雄比、配对时间及空间大小对台湾甲腹茧蜂交配率的影响.结果表明,随着温度的升高,交配率逐渐上升,32℃最高为 45.0%.不同营养对交配率的影响差异不显著.雌雄比为 1♀:1♂时,交配率最低,仅为 7.5%,当 1♀:7♂时,交配率最高,为 80.0%.随着配对时间的延长,交配率呈上升趋势,当配对时间为 5 d时,交配率最高,为 75.0%.随着空间的体积大小从 348 cm3逐渐增大到 1920 cm3,交配率逐渐下降,最低为 5.0%.综上,最佳因子下台湾甲腹茧蜂交配率为 97.5%.
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猪视网膜上皮细胞的分离培养与鉴定
《畜牧与兽医 》 2023 北大核心
摘要:旨在建立猪视网膜上皮细胞(PRECs)的分离纯化及传代培养方法.采用组织块贴壁法和消化法分离猪视网膜细胞(PRCs),经差速消化法纯化细胞,筛选确定最优培养条件并鉴定细胞生物学特性.结果:消化法分离的细胞约1周长成单层,组织块贴壁法约2周长满单层,但活力更高;PRCs主要形态为长梭形和大理石样,呈现为2种形态细胞混合生长;差速消化法纯化细胞后,经间接免疫荧光鉴定细胞角蛋白(CK18和CK19),确定该细胞为上皮细胞;细胞接种猪圆环病毒2型(PCV2)可产生明显病变.综上,本试验成功分离获得PRECs,含胎牛血清浓度为12%的α-MEM为最优培养基,该细胞支持PCV2增殖并产生明显的细胞病变,为进一步建立稳定传代的猪视网膜上皮细胞系及研究PCV2感染及致病机理提供基础.
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