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基于转录组挖掘香菇木质纤维素降解相关基因

食用菌学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:对用木屑培养料(木屑组)和PDA培养基(PDA组)培养的香菇(Lentinula edodes)菌丝进行转录组测序分析,对两组样本进行主成分分析和相关性分析,对差异表达基因进行筛选和聚类分析;以PDA组为对照,对木屑组中显著差异表达的基因进行筛选以及GO功能富集、KEGG代谢通路分析;采用定量PCR方法验证9个差异表达基因表达情况。结果表明:培养基质造成的基因表达差异大于菌株,8个样本可分为两组(PDA组和木屑组);与PDA组相比,木屑组有677个基因的表达存在显著差异,其中445个基因(与木质纤维素降解相关的180个)上调,232个基因(与木质纤维素降解相关的38个)下调,表明木屑培养基能够显著诱导木质纤维素降解相关基因表达。GO功能富集分析结果表明,上调表达基因在氧化还原酶活性、水解酶活性、代谢过程、水解酶活性(水解O-糖基化合物)、水解酶活性(作用于糖基键)等代谢过程中显著富集。KEGG代谢通路分析结果表明,上调表达基因在溶酶体、转运蛋白、氨基糖和核苷酸糖代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、淀粉和蔗糖代谢、肽酶和抑制剂通路中显著富集;下调表达基因在MAPK信号通路-酵母、不饱和脂肪酸生物合成、二噁英降解通路中显著富集。研究结果为揭示香菇培养基质利用的分子机制和选育高效利用基质菌株提供参考。

关键词: 香菇 转录组分析 木质纤维素 基质利用

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农产品检测用脱氧雪腐镰刀菌烯醇纯度标准物质的研制

南京农业大学学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:[目的]本文旨在研制脱氧雪腐镰刀菌烯醇(deoxynivalenol,DON)国家级纯度标准物质,为农产品中DON的检测等工作提供物质基础.[方法]利用质量平衡法和定量核磁共振法对DON纯度标准物质进行纯度定值.质量平衡法包括采用液相色谱面积归一化法测定DON主成分含量,采用卡尔费休库仑法测定纯度标准物质中水分含量,采用顶空气相色谱-质谱法测定挥发性杂质含量,以及采用电感耦合等离子质谱法测定无机离子杂质含量.定量核磁共振法采用苯甲酸为内标,选择合适的共振峰,内标法定量标准物质的纯度,并对标准物质进行均匀性、稳定性检测和不确定度评估.[结果]质量平衡法的纯度定值结果为 99.47%,定量核磁共振法定值结果为 99.45%,最终所研制的DON纯度标准物质的纯度为 99.5%,扩展不确定度为 0.4%,均匀性良好,且满足 12 个月以上的稳定性要求.[结论]本试验所研制的DON纯度标准物质符合国家标准物质技术规范,目前已被批准为国家一级标准物质,并已被用于小麦、玉米等农产品实际检测过程中.

关键词: 脱氧雪腐镰刀菌烯醇 标准物质 质量平衡法 定量核磁共振法 不确定度评估

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基于简化基因组的上海水牛遗传结构分析和家系鉴定

上海畜牧兽医通讯 2024

摘要:为提高上海水牛的育种效率和遗传种质资源丰富度,采用基因测序分型(genotyping by sequencing,GBS)技术对8 0头上海水牛进行基因组测序,质控后获得高质量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),进行群体亲缘关系以及近交系数分析。结果显示:从80头上海水牛的24条常染色体和1条性染色体上共检出的99 963个高质量SNP位点、874个连续纯合片段(runs of homozygosity, ROH);80头上海水牛分为2个大支(家系),A1和A2属于第一大支(家系A),包含9头公水牛、18头母水牛;B1、B2和B3属于第二大支(家系B),包含16头公水牛、37头母水牛。基于ROH测算近交系数的结果显示:25头公水牛和55头母水牛的平均近交系数分别为0.014 5和0.011 4。本研究构建了上海水牛家系,揭示了上海水牛的近交状态,为上海水牛繁育工作提供了科学依据。

关键词: 上海水牛 简化基因组测序 长纯合片段 近交系数

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国内食用农产品质量安全舆情风险特征研究

上海农业学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:利用描述性统计分析、方差分析、相关系数分析和回归分析,对2012-2019年国内食用农产品质量安全事件舆情实时监测数据进行分析,通过事件发生的时间节点、发生区域、风险诱因、行业、产业链环节及报道媒体的特征揭示国内食用农产品质量安全舆情风险发生发展的趋势.结果表明:舆情事件发生具有周期性,夏秋为高峰期;广东、山东、浙江、北京等地为舆情问题事件高发区域;风险诱因具有复杂性,"违禁农兽渔药及农兽渔药残留"(27.03%)、"制假售假及违法违规加工"(22.06%)和"非法添加"(15.00%)为前三诱因;发生行业具有集中性,多在种植业(30.10%)和畜牧业(29.86%);问题多出现在产业链前端,即生产和初加工环节;报道问题事件的首发媒体主要为报纸(45.30%)和网站(43.59%).

关键词: 食用农产品 质量安全 舆情监测 舆情风险 舆情特征

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基于改进YOLOv8卷积神经网络的蟹味菇检测方法

农业工程 2024

摘要:针对蟹味菇生产过程中更好地预估产量,对生长状态做到实时检测的问题,提出了一种基于改进YOLOv8卷积神经网络的蟹味菇识别检测方法。该方法参照PASCAL VOC数据集格式,构建了蟹味菇目标检测数据集,采用添加CBAM注意力机制对原算法进行改进,并且与Faster R-CNN、SSD(single shot multibox detector)、原始YOLOv8等算法进行模型性能的试验对比。试验结果表明,改进的算法明显优于其他算法,其在测试集上的平均精度均值(mean average precision,mAP)和检测速度分别达到95%和91帧/s。此检测精度与检测时间满足蟹味菇的实时识别检测任务,为预估蟹味菇产量,提高生产管理水平提供了理论技术支持。

关键词: YOLOv8 卷积神经网络 蟹味菇 目标检测 CBAM

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稻田施氮量对水稻产量和稻米品质的影响

土壤通报 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】明确适宜稻田施氮量以保障水稻产量和稻米品质提升,协调土壤养分和水稻品质之间的供需平衡。【方法】以“沪旱61”为供试水稻品种,设置了4个稻田施氮量(折合纯N分别为0、100、200和300 kg hm-2)以解析稻田施氮量对水稻产量和稻米品质的影响。【结果】施氮处理的水稻产量在5.2~9.0 t hm-2范围,比对照提升41.0%~71.7%。随施氮量的增加,稻米中的蛋白质含量增加;而直链淀粉含量、胶稠度和食味值下降。随施氮量的增加,土壤中铵态氮和硝态氮含量增加;速效磷和速效钾含量下降,降幅分别达9.7%~45.5%和23.3%~70.7%。稻米食味品质是影响稻米综合品质的关键因素。统计学分析表明,稻米的蛋白质含量与土壤中硝态氮、速效钾和速效磷含量呈负相关,而直链淀粉含量与土壤中硝态氮、速效钾和速效磷含量呈正相关。【结论】在保证水稻稳产和稻米品质提升的前提下,“沪旱61”水稻栽培的最佳氮素用量为200 kg hm-2

关键词: 水稻 稻米品质 施氮量 长期定位

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上海科技特派员:为农业高质量发展和人民高品质生活服务

中国农村科技 2024

摘要:上海市农业科学院成立于1960年,现已发展成为一个学科较齐全、研发和成果转化能力较强,为上海和全国农业发展提供科技支撑的地方综合性农业科研机构.2020年时任中共中央政治局委员、上海市委书记李强给上海市农业科学院建院60周年的批示指出:我国是农业大国,农业科技创新、推广至关重要.希望市农科院立足国情,扎根"三农",力争取得更多科技创新成果,培养更多"三农"科技人才,推动更多科研成果转化,为推进乡村振兴战略、建设农业强国作出新的更大贡献.

关键词: 乡村振兴战略 科研成果转化 农业科研机构 农业科技创新 科技人才 成果转化能力 上海市农业科学院 高品质生活

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节水抗旱稻"八月香"经济效益及市场调查分析

作物研究 2024

摘要:基于种植户典型调查和市场消费者问卷调查,就节水抗旱稻“八月香”及其不同轮作模式的经济效益进行比较分析,并调查了市场对“八月香”的认知情况和偏好。结果显示:“八月香”销售大米的综合利润要高于当地传统水稻品种,并且其单位面积化肥和农药的施用量明显减少。水稻种植户和消费者对“八月香”的认知程度还有待提升,“八月香”大米的口感和性价比认可度较高,但仍有提升空间。从加强品种和品牌的宣传推广力度、完善和标准化配套的种植技术模式、加强对优良新品种的选育等方面对进一步促进“八月香”的推广提出了对策与建议。

关键词: 水稻 种植模式 八月香 经济效益 市场调查

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灵芝β-葡寡糖体外抗炎活性及机制探究

菌物学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:本研究通过脂多糖(LPS)诱导建立了Caco-2细胞体外肠炎模型,探究不同聚合度(DPs)灵芝β-葡寡糖的抗炎活性和作用机制.比较白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)以及活性氧(ROS)的水平可知,不同聚合度灵芝β-葡寡糖组分均能抑制LPS诱导的Caco-2细胞中IL-1β、TNF-α及ROS的释放;进一步通过蛋白免疫印迹法(Western blot)对其抗炎机制进行探究,发现灵芝β-葡寡糖能显著降低LPS诱导的Caco-2细胞NF-κB p65蛋白的水平.说明灵芝β-葡寡糖能通过调节NF-κB p65蛋白的表达下调炎症因子水平、减少细胞内氧化应激,从而在肠细胞中产生抗炎作用,其中聚合度为8-24的F3组分作用效果最佳.本研究可为灵芝β-葡寡糖在抗炎功能活性中的应用提供理论基础.

关键词: 灵芝 β-葡寡糖 CACO-2细胞 抗炎 NF-ΚB信号通路

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上海金山区天敌昆虫防治设施蔬菜害虫探索性应用

长江蔬菜 2024

摘要:为了守护好人民群众“舌尖上的安全”,持续改善农业农村生态环境,迫切需要转变过度依赖化学农药防病治虫的方式,大力推进绿色防控措施,实施病虫害综合防治、可持续治理。总结了多年应用天敌昆虫防治设施蔬菜害虫的心得,提出了利用天敌防治应遵循天敌保护、利用、投放依次递进,通过种植载体植物建立适宜天敌自然繁扩的“天敌繁育岛”,构建田间开放天敌饲养系统的措施。

关键词: 天敌昆虫 蔬菜 利用保护 天敌繁育岛 农药减量

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