萝卜乙烯合成途径基因的鉴定及对胁迫的响应

刘同金; 徐铭婕; 崔群香; 张爱慧; 包崇来; 王长义; 《西北植物学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：该研究通过生物信息学方法,对萝卜(Raphanus sativus L.)乙烯合成途径关键结构基因(MAT、ACS和ACO)家族成员进行鉴定,并利用转录组数据和荧光定量方法探究其组织表达和对生物及非生物胁迫的响应.结果表明:(1)萝卜基因组中包含8个MAT、16个ACS和7个ACO基因,均可分为3个亚家族.(2)这些基因启动子中至少含有1个光响应顺式作用元件;除ACO1.1和ACO3外,其余基因启动子中均至少含有一种响应植物激素的顺式作用元件;多个基因启动子中含有响应生物及非生物胁迫的顺式作用元件.(3)转录组数据分析发现,萝卜所有MAT、ACS6.1和ACO2/3/4在叶片中均具较高的表达量;根癌农杆菌侵染诱导抗病萝卜的MAT2-4、ACS2/7.1/7.2和ACO1.1/1.2/4显著上调表达,而感病材料多个基因下调表达;铅、镉和铬胁迫均显著促进MAT4.2和ACO1.1/4的表达,但抑制MAT1和ACO5.1的表达;4℃低温显著抑制MAT2.1/2.2/4.1和ACO1.1/5.2的表达.(4)qRT-PCR分析表明,NaCl和PEG-6000均显著促进ACO5.1/5.2的表达,但抑制MAT4.1和ACO4的表达;果糖和蔗糖可能参与了萝卜对PEG-6000胁迫的响应.该结果为研究萝卜乙烯合成途径基因家族成员的功能奠定了基础.

关键词： 乙烯 基因表达 冷胁迫 重金属胁迫 根癌农杆菌侵染

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基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用

杨易; 黎庭耀; 李国景; 陈汉才; 沈卓; 周轩; 吴增祥; 吴新义; 张艳; 《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：选取3份长豇豆种质资源进行全基因组重测序,利用重测序数据挖掘InDel位点,根据这些位点开发分子标记,并验证这些标记的有效性和应用价值.经过严格筛选,获得981个易于凝胶电泳检测的长度大于30 bp且多态性高的InDel位点,挑选其中在基因组上均匀分布的165个设计引物并进行验证.用6份长豇豆材料对165对引物进行初筛,其中162对可获得PCR扩增产物,共扩增出673条条带;85对引物表现出多态性,多态性带333条(占总带数的49.48%).利用85个多态性高的标记对173份长豇豆资源进行基因分型和遗传多样性分析,共检测到333个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.01~0.37,平均值为0.29;基因多样性指数变异范围为0.01~0.50,平均值为0.36,表明现有长豇豆资源遗传背景相对狭窄.通过聚类分析,173份长豇豆被分为2个类群,成功将不同类型长豇豆划分到不同亚群.另外,选用亲本间多态性标记用于6个杂交组合的F1代真实性鉴定,鉴定出5个真实杂交种.本研究所开发的多态性InDel标记在长豇豆遗传多样性分析、杂交种纯度鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位和分子标记辅助选择育种等方面具有很好的应用前景.

关键词： 长豇豆 InDel标记 遗传多样性 F1代真实性鉴定

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浙江省典型土壤类型整段标本的采集和制作

庄俐; 邹平; 麻万诸; 沈阿林; 《土壤 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：土壤整段剖面标本能真实反映出完整的土体结构和土壤性态，既可为土壤演变历史的科学研究提供实体样本，也可为土壤知识的科普和专业交流提供基础平台。浙江省农业科学院于2019年启动建设“农业管理与土壤演变研究展示平台”，采集和制作了浙江省典型土壤整段标本97个。本文介绍了不同类型土壤整段剖面标本采集与制作过程中遇到的问题以及解决方案，旨在为今后土壤整段标本的采集和制作提供借鉴。

关键词： 土壤整段标本 采集 制作 浙江省

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绵羊皮肤成纤维细胞的分离培养和鉴定

胡馨予; 姚逸安; 俞可心; 胡情情; 姜俊芳; 蒋永清; 石国庆; 万鹏程; 代蓉; 管峰; 《中国细胞生物学学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：绵羊成纤维细胞的分离培养是羊毛发育相关基因功能研究及分子育种研究的重要基础技术和手段,但是现有贴壁法和胰蛋白酶消化法分离培养所需时间长、效率低,双酶消化法与差速贴壁筛选法对绵羊皮肤成纤维细胞的分离培养效果尚不清楚.该实验目的在于通过优化绵羊皮肤成纤维细胞分离培养过程,提高培养效率和细胞纯度.采集新生羔羊的耳皮肤组织,采用胰蛋白酶和I型胶原酶联合消化法进行绵羊皮肤成纤维细胞的原代分离培养,培养2~3天后进行传代分离,直至获得高纯度的成纤维细胞,该过程用时约7天.免疫荧光鉴定结果表明,获得的绵羊皮肤成纤维细胞纯度达100%.该实验采用优化的双酶消化法与差速贴壁筛选分离成纤维细胞,提高了绵羊皮肤成纤维细胞分离培养效率,大大缩短了培养周期,提高了细胞纯度.

关键词： 绵羊 成纤维细胞 皮肤组织 分离培养 双酶消化法

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掌叶覆盆子染色体计数及基因组大小测定

金亮; 李春楠; 詹书侠; 李小白; 华金渭; 《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：掌叶覆盆子(Rubus chingii Hu)是重要的药用植物,由于基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究采用根尖染色体制片技术来确定其倍性;利用流式细胞术和K-mer分析方法对其基因组大小进行了测定.结果如下,掌叶覆盆子根尖染色体数目为2n=2x=14;采用流式细胞术,以萝卜'Saxa'为内标测定的掌叶覆盆子基因组大小为(255.39±7.58)Mb;K-mer分析估测的掌叶覆盆子基因组大小为262.2 Mb,杂合率为0.91%,重复序列比例为42.54%;根据各分析指标,推测该掌叶覆盆子基因组为一般复杂基因组.本研究结果将为掌叶覆盆子的全基因组测序研究提供重要参考.

关键词： 掌叶覆盆子 染色体数目 基因组大小 流式细胞术 K-mer分析

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食品新技术在生鲜农产品供应链绿色保鲜中的应用

郜海燕; 吴伟杰; 穆宏磊; 房祥军; 陈慧芝; 杨海龙; 陈杭君; 《中国食品学报 》 2022 EI 北大核心 CSCD

摘要：我国生鲜农产品总产量逐年递增,已成为全球第一大国.为实现由农业大国向农业强国的转变,供应链绿色保鲜技术的发展与应用是其关键所在之一.本文综述农产品供应链发展现状、存在的问题及所面临的挑战,重点介绍食品新技术在生鲜农产品的分级、保鲜、包装、溯源等方面的应用研究进展,提出未来主要研究方向,旨在为推动现代化农产品供应链绿色保鲜技术的应用与发展提供参考.

关键词： 供应链 绿色保鲜 新技术 生鲜农产品

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紫花野菊软腐病的病原鉴定

郭方其; 叶琪明; 吴超; 方丽; 武军; 谢昀烨; 王汉荣; 《植物病理学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：＜正＞紫花野菊（Chrysanthemum zawadskii Herbich）,又称山菊、西伯利亚菊，是浙江省淳安县高山特色茶用菊花，饮用历史悠久。该菊味微苦，性温和，有清热解毒和消炎降火的功效。2020年5月，淳安县多个苗圃发现一种紫花野菊茎叶部病害，发于幼苗茎基部，或植株的中上部茎，初期表现为病部产生湿润状暗绿色斑点，遇雨水病斑呈水渍状迅速扩展，茎表皮组织发黑腐烂，无臭味，病原细菌沿导管向叶柄和叶脉发展，叶柄及叶脉发黑，叶片瘫软，

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甜樱桃新品种'江南锦'

吴延军; 刘庆忠; 陈鸿才; 戚行江; 朱东姿; 郑家祥; 曹学敏; 方丹燕; 《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：‘江南锦’是从‘大紫’（♀）ב那翁’（♂）的杂交后代中选育出的樱桃新品种。果实肾形，果柄长，平均单果质量6～8 g，果形指数0.92；果皮较薄，黄底带红晕；果肉细腻、软糯、酸甜适口，可溶性固形物含量20.7%；裂果率低，畸形果少。适宜浙江气候及相似生境设施栽培，适合观光采摘。

关键词： 樱桃 甜樱桃 品种

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利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP

刘庭付; 李汉美; 汪宝根; 吴苏淇; 李素娟; 王琳琳; 李国景; 吴新义; 《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：蚕豆(Viciafaba L.)是中国一种重要的食用豆类作物.由于蚕豆基因组较大,尚无参考基因组,因而目前蚕豆上SNP标记数量有限.为了开发全基因组范围内的SNP,本研究对8份蚕豆地方品种进行了简化基因组测序,共获得35.47 Gb的数据,每份种质平均测序量为4.77 Gb;生成Reads总数为245 443 516个,单个Read平均长度为144 bp,单个种质获得的平均Reads数目为30 680 439.5;Q20和Q30分别大于97.89%和93.83%,GC含量变异幅度为38.05%~40.09%.利用无参考基因组情况下特殊的贝叶斯算法,从中共鉴定到3 722个SNP,单个种质上鉴定出的SNP数目 变异为3 278~3 578,其中大部分种质中纯合SNP突变数目大于杂合SNP突变数目.突变类型中,T∶A->C∶G突变类型所占的比例最大(平均38.8%),其次为C∶G->T∶A(平均28.0%),出现比例最小的为T∶A->A∶T(平均7.50%).本研究选择了 31个SNP转化为KASP标记,在46份种质中的扩增成功率为66.7%.本研究所鉴定的SNP为蚕豆种质资源鉴定、基因定位及分子育种提供了有力的遗传工具.

关键词： 蚕豆;SNP;简化基因组测序;KASP

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水稻叶片早衰突变体ospls7的生理特性及其基因定位

黄福灯; 黄妍; 金泽艳; 贺焕焕; 李春寿; 程方民; 潘刚; 《作物学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：衰老是叶片发育的最后阶段,但叶片,尤其是功能叶,早衰将影响作物的产量与品质,因此,研究叶片早衰的分子生理机制对培育耐早衰优良品种具有重要意义.通过60Co-γ 辐射诱变旱稻Monolaya获得一个稳定遗传的叶片早衰突变体ospls7,本文对其形态、叶片衰老生理特征、茎节细胞特性以及衰老性状遗传与基因定位等方面进行了研究.大田条件下,突变体ospls7叶片早衰性状始于三至四叶期幼苗,主要表现为:叶尖及中上部叶边缘黄色褐化并最终枯萎,成熟期穗长和各茎节长度均极显著短于野生型对照,最终导致植株矮化.究其原因,可能是由于突变体茎节细胞变短.叶片衰老生理结果表明,与野生型对照相比,孕穗期突变体ospls7倒二叶和倒三叶的叶绿素总含量、净光合速率、可溶性蛋白、过氧化氢酶活性均极显著降低,致使其叶片中H2O2大量累积并引起丙二醛含量急剧增加.同时,孕穗期突变体ospls7剑叶、倒二叶和倒三叶的内源ABA含量均极显著高于野生型对照,qRT-PCR结果证实ABA大量累积的原因在于ABA合成基因OsNCED3和OsAAO3显著上调,而其代谢基因OsABA8ox2和OsABA8ox3则显著下调.遗传分析结果表明,突变体ospls7的叶片早衰性状受单隐性核基因调控,进一步利用图位克隆技术将该基因定位于10号染色体的InDel标记ID74-33/34和SSR标记RM25040之间,物理距离为207 kb,这些结果为最终克隆OsPLS7基因并研究其功能奠定了基础.

关键词： 水稻 ospls7 叶片早衰 生理分析 基因定位

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